Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U8

Snx5, Sorting nexin-5, mousemouse

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Length 404 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx5Q9D8U8 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snx5Q9D8U8 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snx5Q9D8U8 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snx5Q9D8U8 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snx5Q9D8U8 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snx5Q9D8U8 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snx5Q9D8U8 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snx5Q9D8U8 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Snx5Q9D8U8 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snx5Q9D8U8 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snx5Q9D8U8 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snx5Q9D8U8 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snx5Q9D8U8 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snx5Q9D8U8 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snx5Q9D8U8 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snx5Q9D8U8 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snx5Q9D8U8 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snx5Q9D8U8 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snx5Q9D8U8 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snx5Q9D8U8 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snx5Q9D8U8 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snx5Q9D8U8 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snx5Q9D8U8 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snx5Q9D8U8 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snx5Q9D8U8 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Snx5Q9D8U8 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snx5Q9D8U8 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snx5Q9D8U8 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snx5Q9D8U8 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snx5Q9D8U8 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snx5Q9D8U8 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snx5Q9D8U8 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snx5Q9D8U8 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snx5Q9D8U8 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snx5Q9D8U8 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snx5Q9D8U8 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snx5Q9D8U8 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snx5Q9D8U8 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snx5Q9D8U8 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snx5Q9D8U8 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snx5Q9D8U8 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snx5Q9D8U8 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snx5Q9D8U8 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snx5Q9D8U8 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Snx5Q9D8U8 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snx5Q9D8U8 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snx5Q9D8U8 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snx5Q9D8U8 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snx5Q9D8U8 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snx5Q9D8U8 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snx5Q9D8U8 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snx5Q9D8U8 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snx5Q9D8U8 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snx5Q9D8U8 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snx5Q9D8U8 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snx5Q9D8U8 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snx5Q9D8U8 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snx5Q9D8U8 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snx5Q9D8U8 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snx5Q9D8U8 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snx5Q9D8U8 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snx5Q9D8U8 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snx5Q9D8U8 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snx5Q9D8U8 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snx5Q9D8U8 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snx5Q9D8U8 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snx5Q9D8U8 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Snx5Q9D8U8 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Snx5Q9D8U8 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Snx5Q9D8U8 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Snx5Q9D8U8 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Snx5Q9D8U8 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Snx5Q9D8U8 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Snx5Q9D8U8 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Snx5Q9D8U8 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Snx5Q9D8U8 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx5Q9D8U8 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx5Q9D8U8 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx5Q9D8U8 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx5Q9D8U8 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx5Q9D8U8 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx5Q9D8U8 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx5Q9D8U8 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx5Q9D8U8 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx5Q9D8U8 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx5Q9D8U8 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx5Q9D8U8 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx5Q9D8U8 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx5Q9D8U8 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx5Q9D8U8 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx5Q9D8U8 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx5Q9D8U8 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Snx5Q9D8U8 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx5Q9D8U8 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx5Q9D8U8 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx5Q9D8U8 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx5Q9D8U8 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Snx5Q9D8U8 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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