Protein–RNA interactions for Protein: Q9D727

Uncharacterized protein C6orf226 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D727 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Q9D727 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Q9D727 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q9D727 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q9D727 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q9D727 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q9D727 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q9D727 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q9D727 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q9D727 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q9D727 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q9D727 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q9D727 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q9D727 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q9D727 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Q9D727 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Q9D727 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q9D727 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q9D727 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q9D727 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q9D727 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q9D727 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q9D727 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q9D727 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q9D727 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q9D727 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q9D727 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q9D727 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q9D727 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q9D727 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q9D727 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q9D727 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q9D727 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q9D727 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q9D727 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q9D727 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q9D727 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q9D727 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q9D727 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q9D727 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q9D727 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q9D727 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q9D727 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q9D727 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Q9D727 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q9D727 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q9D727 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q9D727 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q9D727 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q9D727 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q9D727 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q9D727 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q9D727 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q9D727 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q9D727 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q9D727 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q9D727 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q9D727 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q9D727 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Q9D727 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q9D727 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q9D727 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q9D727 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q9D727 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q9D727 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q9D727 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q9D727 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q9D727 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q9D727 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Q9D727 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Q9D727 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q9D727 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q9D727 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q9D727 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q9D727 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q9D727 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q9D727 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q9D727 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q9D727 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q9D727 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q9D727 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q9D727 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q9D727 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q9D727 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q9D727 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Q9D727 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q9D727 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Q9D727 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q9D727 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q9D727 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q9D727 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q9D727 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q9D727 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q9D727 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q9D727 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q9D727 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q9D727 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q9D727 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q9D727 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Q9D727 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms