Protein–RNA interactions for Protein: Q9D620

Rab11fip1, Rab11 family-interacting protein 1, mousemouse

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Length 645 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip1Q9D620 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rab11fip1Q9D620 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rab11fip1Q9D620 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rab11fip1Q9D620 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rab11fip1Q9D620 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rab11fip1Q9D620 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rab11fip1Q9D620 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rab11fip1Q9D620 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rab11fip1Q9D620 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rab11fip1Q9D620 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Rab11fip1Q9D620 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Rab11fip1Q9D620 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Rab11fip1Q9D620 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rab11fip1Q9D620 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rab11fip1Q9D620 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Rab11fip1Q9D620 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Rab11fip1Q9D620 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rab11fip1Q9D620 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Rab11fip1Q9D620 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rab11fip1Q9D620 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rab11fip1Q9D620 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rab11fip1Q9D620 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Rab11fip1Q9D620 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rab11fip1Q9D620 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rab11fip1Q9D620 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rab11fip1Q9D620 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rab11fip1Q9D620 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rab11fip1Q9D620 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rab11fip1Q9D620 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Rab11fip1Q9D620 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rab11fip1Q9D620 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rab11fip1Q9D620 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rab11fip1Q9D620 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rab11fip1Q9D620 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Rab11fip1Q9D620 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rab11fip1Q9D620 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rab11fip1Q9D620 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rab11fip1Q9D620 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Rab11fip1Q9D620 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Rab11fip1Q9D620 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rab11fip1Q9D620 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rab11fip1Q9D620 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rab11fip1Q9D620 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rab11fip1Q9D620 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rab11fip1Q9D620 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rab11fip1Q9D620 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rab11fip1Q9D620 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rab11fip1Q9D620 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rab11fip1Q9D620 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rab11fip1Q9D620 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Rab11fip1Q9D620 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rab11fip1Q9D620 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Rab11fip1Q9D620 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rab11fip1Q9D620 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Rab11fip1Q9D620 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Rab11fip1Q9D620 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Rab11fip1Q9D620 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Rab11fip1Q9D620 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rab11fip1Q9D620 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Rab11fip1Q9D620 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rab11fip1Q9D620 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rab11fip1Q9D620 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Rab11fip1Q9D620 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Rab11fip1Q9D620 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rab11fip1Q9D620 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rab11fip1Q9D620 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rab11fip1Q9D620 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rab11fip1Q9D620 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rab11fip1Q9D620 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rab11fip1Q9D620 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Rab11fip1Q9D620 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rab11fip1Q9D620 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rab11fip1Q9D620 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rab11fip1Q9D620 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rab11fip1Q9D620 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rab11fip1Q9D620 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rab11fip1Q9D620 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rab11fip1Q9D620 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rab11fip1Q9D620 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rab11fip1Q9D620 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Rab11fip1Q9D620 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Rab11fip1Q9D620 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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