Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J1

Efhd1, EF-hand domain-containing protein D1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efhd1Q9D4J1 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Efhd1Q9D4J1 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Efhd1Q9D4J1 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Efhd1Q9D4J1 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Efhd1Q9D4J1 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Efhd1Q9D4J1 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Efhd1Q9D4J1 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Efhd1Q9D4J1 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Efhd1Q9D4J1 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Efhd1Q9D4J1 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Efhd1Q9D4J1 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Efhd1Q9D4J1 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Efhd1Q9D4J1 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Efhd1Q9D4J1 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Efhd1Q9D4J1 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Efhd1Q9D4J1 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Efhd1Q9D4J1 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Efhd1Q9D4J1 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Efhd1Q9D4J1 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Efhd1Q9D4J1 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Efhd1Q9D4J1 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Efhd1Q9D4J1 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Efhd1Q9D4J1 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Efhd1Q9D4J1 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Efhd1Q9D4J1 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Efhd1Q9D4J1 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Efhd1Q9D4J1 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Efhd1Q9D4J1 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Efhd1Q9D4J1 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Efhd1Q9D4J1 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Efhd1Q9D4J1 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Efhd1Q9D4J1 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Efhd1Q9D4J1 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Efhd1Q9D4J1 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Efhd1Q9D4J1 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Efhd1Q9D4J1 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Efhd1Q9D4J1 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Efhd1Q9D4J1 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Efhd1Q9D4J1 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Efhd1Q9D4J1 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Efhd1Q9D4J1 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Efhd1Q9D4J1 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Efhd1Q9D4J1 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Efhd1Q9D4J1 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Efhd1Q9D4J1 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Efhd1Q9D4J1 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Efhd1Q9D4J1 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Efhd1Q9D4J1 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Efhd1Q9D4J1 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Efhd1Q9D4J1 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Efhd1Q9D4J1 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Efhd1Q9D4J1 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Efhd1Q9D4J1 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Efhd1Q9D4J1 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Efhd1Q9D4J1 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Efhd1Q9D4J1 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Efhd1Q9D4J1 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Efhd1Q9D4J1 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Efhd1Q9D4J1 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Efhd1Q9D4J1 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Efhd1Q9D4J1 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Efhd1Q9D4J1 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Efhd1Q9D4J1 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Efhd1Q9D4J1 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Efhd1Q9D4J1 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Efhd1Q9D4J1 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Efhd1Q9D4J1 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Efhd1Q9D4J1 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Efhd1Q9D4J1 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Efhd1Q9D4J1 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Efhd1Q9D4J1 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Efhd1Q9D4J1 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Efhd1Q9D4J1 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Efhd1Q9D4J1 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Efhd1Q9D4J1 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Efhd1Q9D4J1 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Efhd1Q9D4J1 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Efhd1Q9D4J1 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Efhd1Q9D4J1 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Efhd1Q9D4J1 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Efhd1Q9D4J1 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Efhd1Q9D4J1 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Efhd1Q9D4J1 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Efhd1Q9D4J1 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Efhd1Q9D4J1 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Efhd1Q9D4J1 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Efhd1Q9D4J1 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Efhd1Q9D4J1 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Efhd1Q9D4J1 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Efhd1Q9D4J1 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Efhd1Q9D4J1 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Efhd1Q9D4J1 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Efhd1Q9D4J1 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Efhd1Q9D4J1 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Efhd1Q9D4J1 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Efhd1Q9D4J1 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Efhd1Q9D4J1 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Efhd1Q9D4J1 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Efhd1Q9D4J1 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Efhd1Q9D4J1 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms