Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZH8

Ccdc77, Coiled-coil domain-containing protein 77, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc77Q9CZH8 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc77Q9CZH8 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc77Q9CZH8 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc77Q9CZH8 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc77Q9CZH8 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc77Q9CZH8 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc77Q9CZH8 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc77Q9CZH8 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc77Q9CZH8 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc77Q9CZH8 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc77Q9CZH8 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc77Q9CZH8 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc77Q9CZH8 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc77Q9CZH8 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc77Q9CZH8 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc77Q9CZH8 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc77Q9CZH8 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc77Q9CZH8 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc77Q9CZH8 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc77Q9CZH8 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc77Q9CZH8 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc77Q9CZH8 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc77Q9CZH8 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc77Q9CZH8 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc77Q9CZH8 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc77Q9CZH8 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc77Q9CZH8 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc77Q9CZH8 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc77Q9CZH8 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc77Q9CZH8 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc77Q9CZH8 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc77Q9CZH8 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc77Q9CZH8 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc77Q9CZH8 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc77Q9CZH8 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc77Q9CZH8 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc77Q9CZH8 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc77Q9CZH8 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc77Q9CZH8 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc77Q9CZH8 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc77Q9CZH8 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc77Q9CZH8 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc77Q9CZH8 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc77Q9CZH8 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc77Q9CZH8 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc77Q9CZH8 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc77Q9CZH8 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc77Q9CZH8 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc77Q9CZH8 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc77Q9CZH8 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc77Q9CZH8 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc77Q9CZH8 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc77Q9CZH8 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc77Q9CZH8 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc77Q9CZH8 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc77Q9CZH8 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc77Q9CZH8 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc77Q9CZH8 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc77Q9CZH8 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc77Q9CZH8 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc77Q9CZH8 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc77Q9CZH8 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc77Q9CZH8 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc77Q9CZH8 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc77Q9CZH8 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc77Q9CZH8 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc77Q9CZH8 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc77Q9CZH8 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc77Q9CZH8 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc77Q9CZH8 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc77Q9CZH8 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc77Q9CZH8 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc77Q9CZH8 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc77Q9CZH8 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc77Q9CZH8 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc77Q9CZH8 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc77Q9CZH8 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc77Q9CZH8 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc77Q9CZH8 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc77Q9CZH8 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc77Q9CZH8 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc77Q9CZH8 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc77Q9CZH8 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc77Q9CZH8 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc77Q9CZH8 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc77Q9CZH8 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc77Q9CZH8 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc77Q9CZH8 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc77Q9CZH8 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc77Q9CZH8 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc77Q9CZH8 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc77Q9CZH8 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc77Q9CZH8 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc77Q9CZH8 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc77Q9CZH8 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc77Q9CZH8 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc77Q9CZH8 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc77Q9CZH8 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc77Q9CZH8 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc77Q9CZH8 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms