Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ91

Srfbp1, Serum response factor-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srfbp1Q9CZ91 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Srfbp1Q9CZ91 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Srfbp1Q9CZ91 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Srfbp1Q9CZ91 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Srfbp1Q9CZ91 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Srfbp1Q9CZ91 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srfbp1Q9CZ91 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srfbp1Q9CZ91 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srfbp1Q9CZ91 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srfbp1Q9CZ91 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srfbp1Q9CZ91 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srfbp1Q9CZ91 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srfbp1Q9CZ91 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srfbp1Q9CZ91 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srfbp1Q9CZ91 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srfbp1Q9CZ91 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srfbp1Q9CZ91 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srfbp1Q9CZ91 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srfbp1Q9CZ91 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srfbp1Q9CZ91 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srfbp1Q9CZ91 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srfbp1Q9CZ91 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srfbp1Q9CZ91 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srfbp1Q9CZ91 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srfbp1Q9CZ91 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srfbp1Q9CZ91 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srfbp1Q9CZ91 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srfbp1Q9CZ91 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srfbp1Q9CZ91 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srfbp1Q9CZ91 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srfbp1Q9CZ91 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srfbp1Q9CZ91 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srfbp1Q9CZ91 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srfbp1Q9CZ91 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Srfbp1Q9CZ91 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srfbp1Q9CZ91 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srfbp1Q9CZ91 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srfbp1Q9CZ91 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srfbp1Q9CZ91 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srfbp1Q9CZ91 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srfbp1Q9CZ91 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srfbp1Q9CZ91 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srfbp1Q9CZ91 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srfbp1Q9CZ91 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srfbp1Q9CZ91 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srfbp1Q9CZ91 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srfbp1Q9CZ91 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srfbp1Q9CZ91 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srfbp1Q9CZ91 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Srfbp1Q9CZ91 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srfbp1Q9CZ91 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srfbp1Q9CZ91 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srfbp1Q9CZ91 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srfbp1Q9CZ91 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srfbp1Q9CZ91 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srfbp1Q9CZ91 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srfbp1Q9CZ91 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srfbp1Q9CZ91 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srfbp1Q9CZ91 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Srfbp1Q9CZ91 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srfbp1Q9CZ91 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srfbp1Q9CZ91 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srfbp1Q9CZ91 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Srfbp1Q9CZ91 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srfbp1Q9CZ91 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srfbp1Q9CZ91 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srfbp1Q9CZ91 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srfbp1Q9CZ91 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Srfbp1Q9CZ91 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srfbp1Q9CZ91 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Srfbp1Q9CZ91 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srfbp1Q9CZ91 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srfbp1Q9CZ91 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srfbp1Q9CZ91 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srfbp1Q9CZ91 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srfbp1Q9CZ91 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srfbp1Q9CZ91 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srfbp1Q9CZ91 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srfbp1Q9CZ91 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srfbp1Q9CZ91 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srfbp1Q9CZ91 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Srfbp1Q9CZ91 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srfbp1Q9CZ91 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srfbp1Q9CZ91 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Srfbp1Q9CZ91 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srfbp1Q9CZ91 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srfbp1Q9CZ91 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srfbp1Q9CZ91 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srfbp1Q9CZ91 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srfbp1Q9CZ91 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srfbp1Q9CZ91 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srfbp1Q9CZ91 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srfbp1Q9CZ91 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srfbp1Q9CZ91 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srfbp1Q9CZ91 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srfbp1Q9CZ91 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srfbp1Q9CZ91 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srfbp1Q9CZ91 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srfbp1Q9CZ91 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srfbp1Q9CZ91 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms