Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE7

Tmed5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed5Q9CXE7 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmed5Q9CXE7 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmed5Q9CXE7 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmed5Q9CXE7 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmed5Q9CXE7 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmed5Q9CXE7 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmed5Q9CXE7 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmed5Q9CXE7 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmed5Q9CXE7 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmed5Q9CXE7 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmed5Q9CXE7 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmed5Q9CXE7 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmed5Q9CXE7 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmed5Q9CXE7 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmed5Q9CXE7 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmed5Q9CXE7 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmed5Q9CXE7 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmed5Q9CXE7 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmed5Q9CXE7 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmed5Q9CXE7 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmed5Q9CXE7 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmed5Q9CXE7 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmed5Q9CXE7 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmed5Q9CXE7 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmed5Q9CXE7 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmed5Q9CXE7 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmed5Q9CXE7 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmed5Q9CXE7 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmed5Q9CXE7 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmed5Q9CXE7 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmed5Q9CXE7 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmed5Q9CXE7 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmed5Q9CXE7 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmed5Q9CXE7 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmed5Q9CXE7 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmed5Q9CXE7 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmed5Q9CXE7 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmed5Q9CXE7 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmed5Q9CXE7 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmed5Q9CXE7 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmed5Q9CXE7 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmed5Q9CXE7 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmed5Q9CXE7 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmed5Q9CXE7 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmed5Q9CXE7 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmed5Q9CXE7 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmed5Q9CXE7 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmed5Q9CXE7 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmed5Q9CXE7 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmed5Q9CXE7 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmed5Q9CXE7 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmed5Q9CXE7 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmed5Q9CXE7 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmed5Q9CXE7 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmed5Q9CXE7 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmed5Q9CXE7 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmed5Q9CXE7 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmed5Q9CXE7 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmed5Q9CXE7 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmed5Q9CXE7 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmed5Q9CXE7 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmed5Q9CXE7 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmed5Q9CXE7 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmed5Q9CXE7 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmed5Q9CXE7 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmed5Q9CXE7 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmed5Q9CXE7 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmed5Q9CXE7 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmed5Q9CXE7 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmed5Q9CXE7 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmed5Q9CXE7 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmed5Q9CXE7 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmed5Q9CXE7 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmed5Q9CXE7 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmed5Q9CXE7 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmed5Q9CXE7 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmed5Q9CXE7 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmed5Q9CXE7 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmed5Q9CXE7 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmed5Q9CXE7 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmed5Q9CXE7 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmed5Q9CXE7 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmed5Q9CXE7 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmed5Q9CXE7 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmed5Q9CXE7 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmed5Q9CXE7 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmed5Q9CXE7 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmed5Q9CXE7 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmed5Q9CXE7 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmed5Q9CXE7 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmed5Q9CXE7 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmed5Q9CXE7 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmed5Q9CXE7 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmed5Q9CXE7 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmed5Q9CXE7 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmed5Q9CXE7 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmed5Q9CXE7 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmed5Q9CXE7 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmed5Q9CXE7 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmed5Q9CXE7 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms