Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQT5

Pomp, Proteasome maturation protein, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PompQ9CQT5 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PompQ9CQT5 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PompQ9CQT5 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PompQ9CQT5 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PompQ9CQT5 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PompQ9CQT5 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PompQ9CQT5 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PompQ9CQT5 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PompQ9CQT5 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PompQ9CQT5 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PompQ9CQT5 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PompQ9CQT5 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PompQ9CQT5 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PompQ9CQT5 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PompQ9CQT5 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PompQ9CQT5 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PompQ9CQT5 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PompQ9CQT5 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PompQ9CQT5 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PompQ9CQT5 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PompQ9CQT5 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PompQ9CQT5 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PompQ9CQT5 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PompQ9CQT5 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PompQ9CQT5 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PompQ9CQT5 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PompQ9CQT5 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PompQ9CQT5 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PompQ9CQT5 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PompQ9CQT5 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PompQ9CQT5 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PompQ9CQT5 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PompQ9CQT5 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PompQ9CQT5 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PompQ9CQT5 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PompQ9CQT5 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PompQ9CQT5 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PompQ9CQT5 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PompQ9CQT5 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PompQ9CQT5 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PompQ9CQT5 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PompQ9CQT5 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PompQ9CQT5 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PompQ9CQT5 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PompQ9CQT5 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PompQ9CQT5 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PompQ9CQT5 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PompQ9CQT5 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PompQ9CQT5 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PompQ9CQT5 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PompQ9CQT5 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PompQ9CQT5 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PompQ9CQT5 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PompQ9CQT5 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PompQ9CQT5 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PompQ9CQT5 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PompQ9CQT5 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PompQ9CQT5 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PompQ9CQT5 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PompQ9CQT5 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PompQ9CQT5 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PompQ9CQT5 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PompQ9CQT5 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PompQ9CQT5 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PompQ9CQT5 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PompQ9CQT5 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PompQ9CQT5 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PompQ9CQT5 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PompQ9CQT5 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PompQ9CQT5 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PompQ9CQT5 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PompQ9CQT5 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PompQ9CQT5 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PompQ9CQT5 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PompQ9CQT5 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PompQ9CQT5 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PompQ9CQT5 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PompQ9CQT5 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PompQ9CQT5 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PompQ9CQT5 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PompQ9CQT5 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PompQ9CQT5 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PompQ9CQT5 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PompQ9CQT5 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PompQ9CQT5 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PompQ9CQT5 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PompQ9CQT5 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PompQ9CQT5 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PompQ9CQT5 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PompQ9CQT5 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PompQ9CQT5 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PompQ9CQT5 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PompQ9CQT5 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PompQ9CQT5 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PompQ9CQT5 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PompQ9CQT5 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PompQ9CQT5 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PompQ9CQT5 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PompQ9CQT5 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PompQ9CQT5 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms