Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPV1

Ska1, Spindle and kinetochore-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska1Q9CPV1 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ska1Q9CPV1 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ska1Q9CPV1 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ska1Q9CPV1 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ska1Q9CPV1 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ska1Q9CPV1 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ska1Q9CPV1 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ska1Q9CPV1 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ska1Q9CPV1 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ska1Q9CPV1 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ska1Q9CPV1 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ska1Q9CPV1 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ska1Q9CPV1 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ska1Q9CPV1 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ska1Q9CPV1 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ska1Q9CPV1 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ska1Q9CPV1 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ska1Q9CPV1 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ska1Q9CPV1 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ska1Q9CPV1 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ska1Q9CPV1 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ska1Q9CPV1 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ska1Q9CPV1 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ska1Q9CPV1 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ska1Q9CPV1 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ska1Q9CPV1 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ska1Q9CPV1 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ska1Q9CPV1 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ska1Q9CPV1 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Ska1Q9CPV1 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ska1Q9CPV1 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Ska1Q9CPV1 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ska1Q9CPV1 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ska1Q9CPV1 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ska1Q9CPV1 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ska1Q9CPV1 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Ska1Q9CPV1 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ska1Q9CPV1 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ska1Q9CPV1 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ska1Q9CPV1 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ska1Q9CPV1 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ska1Q9CPV1 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ska1Q9CPV1 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ska1Q9CPV1 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ska1Q9CPV1 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ska1Q9CPV1 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ska1Q9CPV1 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ska1Q9CPV1 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ska1Q9CPV1 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ska1Q9CPV1 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ska1Q9CPV1 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ska1Q9CPV1 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ska1Q9CPV1 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ska1Q9CPV1 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ska1Q9CPV1 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ska1Q9CPV1 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ska1Q9CPV1 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ska1Q9CPV1 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ska1Q9CPV1 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ska1Q9CPV1 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ska1Q9CPV1 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ska1Q9CPV1 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ska1Q9CPV1 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ska1Q9CPV1 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ska1Q9CPV1 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ska1Q9CPV1 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ska1Q9CPV1 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ska1Q9CPV1 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ska1Q9CPV1 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ska1Q9CPV1 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ska1Q9CPV1 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ska1Q9CPV1 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Ska1Q9CPV1 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ska1Q9CPV1 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ska1Q9CPV1 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ska1Q9CPV1 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ska1Q9CPV1 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ska1Q9CPV1 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ska1Q9CPV1 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ska1Q9CPV1 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Ska1Q9CPV1 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ska1Q9CPV1 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ska1Q9CPV1 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ska1Q9CPV1 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ska1Q9CPV1 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ska1Q9CPV1 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ska1Q9CPV1 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ska1Q9CPV1 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ska1Q9CPV1 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ska1Q9CPV1 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ska1Q9CPV1 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ska1Q9CPV1 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ska1Q9CPV1 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ska1Q9CPV1 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ska1Q9CPV1 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Ska1Q9CPV1 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ska1Q9CPV1 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ska1Q9CPV1 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ska1Q9CPV1 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ska1Q9CPV1 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms