Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME9

Gtpbp4, Nucleolar GTP-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp4Q99ME9 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gtpbp4Q99ME9 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gtpbp4Q99ME9 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gtpbp4Q99ME9 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gtpbp4Q99ME9 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gtpbp4Q99ME9 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gtpbp4Q99ME9 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gtpbp4Q99ME9 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gtpbp4Q99ME9 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gtpbp4Q99ME9 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gtpbp4Q99ME9 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gtpbp4Q99ME9 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gtpbp4Q99ME9 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gtpbp4Q99ME9 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gtpbp4Q99ME9 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gtpbp4Q99ME9 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gtpbp4Q99ME9 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gtpbp4Q99ME9 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gtpbp4Q99ME9 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gtpbp4Q99ME9 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gtpbp4Q99ME9 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gtpbp4Q99ME9 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gtpbp4Q99ME9 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gtpbp4Q99ME9 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gtpbp4Q99ME9 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gtpbp4Q99ME9 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gtpbp4Q99ME9 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gtpbp4Q99ME9 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gtpbp4Q99ME9 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gtpbp4Q99ME9 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gtpbp4Q99ME9 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gtpbp4Q99ME9 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Gtpbp4Q99ME9 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Gtpbp4Q99ME9 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gtpbp4Q99ME9 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gtpbp4Q99ME9 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gtpbp4Q99ME9 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gtpbp4Q99ME9 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gtpbp4Q99ME9 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gtpbp4Q99ME9 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gtpbp4Q99ME9 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gtpbp4Q99ME9 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gtpbp4Q99ME9 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gtpbp4Q99ME9 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gtpbp4Q99ME9 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gtpbp4Q99ME9 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gtpbp4Q99ME9 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gtpbp4Q99ME9 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Gtpbp4Q99ME9 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gtpbp4Q99ME9 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gtpbp4Q99ME9 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gtpbp4Q99ME9 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gtpbp4Q99ME9 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gtpbp4Q99ME9 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Gtpbp4Q99ME9 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gtpbp4Q99ME9 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Gtpbp4Q99ME9 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gtpbp4Q99ME9 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Gtpbp4Q99ME9 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gtpbp4Q99ME9 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gtpbp4Q99ME9 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gtpbp4Q99ME9 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Gtpbp4Q99ME9 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gtpbp4Q99ME9 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gtpbp4Q99ME9 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gtpbp4Q99ME9 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gtpbp4Q99ME9 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gtpbp4Q99ME9 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gtpbp4Q99ME9 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gtpbp4Q99ME9 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gtpbp4Q99ME9 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gtpbp4Q99ME9 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gtpbp4Q99ME9 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gtpbp4Q99ME9 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gtpbp4Q99ME9 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gtpbp4Q99ME9 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gtpbp4Q99ME9 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gtpbp4Q99ME9 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gtpbp4Q99ME9 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gtpbp4Q99ME9 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gtpbp4Q99ME9 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gtpbp4Q99ME9 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gtpbp4Q99ME9 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gtpbp4Q99ME9 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gtpbp4Q99ME9 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gtpbp4Q99ME9 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gtpbp4Q99ME9 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gtpbp4Q99ME9 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gtpbp4Q99ME9 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gtpbp4Q99ME9 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gtpbp4Q99ME9 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gtpbp4Q99ME9 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gtpbp4Q99ME9 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gtpbp4Q99ME9 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gtpbp4Q99ME9 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gtpbp4Q99ME9 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gtpbp4Q99ME9 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gtpbp4Q99ME9 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gtpbp4Q99ME9 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gtpbp4Q99ME9 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms