Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ7

Rcbtb2, RCC1 and BTB domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb2Q99LJ7 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rcbtb2Q99LJ7 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rcbtb2Q99LJ7 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rcbtb2Q99LJ7 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rcbtb2Q99LJ7 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rcbtb2Q99LJ7 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rcbtb2Q99LJ7 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rcbtb2Q99LJ7 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Rcbtb2Q99LJ7 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Rcbtb2Q99LJ7 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rcbtb2Q99LJ7 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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