Protein–RNA interactions for Protein: Q99KP6

Prpf19, Pre-mRNA-processing factor 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf19Q99KP6 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Prpf19Q99KP6 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Prpf19Q99KP6 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prpf19Q99KP6 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prpf19Q99KP6 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prpf19Q99KP6 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Prpf19Q99KP6 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prpf19Q99KP6 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prpf19Q99KP6 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prpf19Q99KP6 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Prpf19Q99KP6 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prpf19Q99KP6 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prpf19Q99KP6 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prpf19Q99KP6 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prpf19Q99KP6 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prpf19Q99KP6 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prpf19Q99KP6 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Prpf19Q99KP6 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prpf19Q99KP6 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prpf19Q99KP6 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prpf19Q99KP6 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prpf19Q99KP6 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prpf19Q99KP6 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prpf19Q99KP6 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prpf19Q99KP6 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prpf19Q99KP6 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prpf19Q99KP6 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prpf19Q99KP6 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prpf19Q99KP6 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prpf19Q99KP6 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prpf19Q99KP6 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prpf19Q99KP6 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prpf19Q99KP6 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prpf19Q99KP6 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prpf19Q99KP6 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prpf19Q99KP6 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prpf19Q99KP6 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prpf19Q99KP6 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prpf19Q99KP6 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prpf19Q99KP6 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prpf19Q99KP6 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prpf19Q99KP6 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prpf19Q99KP6 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prpf19Q99KP6 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prpf19Q99KP6 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prpf19Q99KP6 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prpf19Q99KP6 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prpf19Q99KP6 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Prpf19Q99KP6 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prpf19Q99KP6 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Prpf19Q99KP6 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prpf19Q99KP6 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prpf19Q99KP6 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prpf19Q99KP6 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prpf19Q99KP6 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prpf19Q99KP6 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prpf19Q99KP6 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prpf19Q99KP6 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prpf19Q99KP6 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prpf19Q99KP6 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prpf19Q99KP6 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Prpf19Q99KP6 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Prpf19Q99KP6 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prpf19Q99KP6 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prpf19Q99KP6 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prpf19Q99KP6 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prpf19Q99KP6 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prpf19Q99KP6 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prpf19Q99KP6 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prpf19Q99KP6 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prpf19Q99KP6 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prpf19Q99KP6 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prpf19Q99KP6 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prpf19Q99KP6 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prpf19Q99KP6 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Prpf19Q99KP6 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prpf19Q99KP6 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prpf19Q99KP6 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prpf19Q99KP6 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prpf19Q99KP6 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prpf19Q99KP6 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prpf19Q99KP6 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prpf19Q99KP6 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prpf19Q99KP6 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prpf19Q99KP6 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prpf19Q99KP6 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prpf19Q99KP6 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Prpf19Q99KP6 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prpf19Q99KP6 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prpf19Q99KP6 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prpf19Q99KP6 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prpf19Q99KP6 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prpf19Q99KP6 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prpf19Q99KP6 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prpf19Q99KP6 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prpf19Q99KP6 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prpf19Q99KP6 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prpf19Q99KP6 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prpf19Q99KP6 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prpf19Q99KP6 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms