Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT1

Gatb, Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GatbQ99JT1 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GatbQ99JT1 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GatbQ99JT1 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GatbQ99JT1 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GatbQ99JT1 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GatbQ99JT1 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GatbQ99JT1 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GatbQ99JT1 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GatbQ99JT1 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GatbQ99JT1 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
GatbQ99JT1 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GatbQ99JT1 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
GatbQ99JT1 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GatbQ99JT1 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GatbQ99JT1 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GatbQ99JT1 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GatbQ99JT1 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GatbQ99JT1 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GatbQ99JT1 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GatbQ99JT1 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GatbQ99JT1 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GatbQ99JT1 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GatbQ99JT1 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GatbQ99JT1 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GatbQ99JT1 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GatbQ99JT1 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GatbQ99JT1 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GatbQ99JT1 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GatbQ99JT1 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GatbQ99JT1 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GatbQ99JT1 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GatbQ99JT1 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
GatbQ99JT1 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GatbQ99JT1 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GatbQ99JT1 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GatbQ99JT1 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
GatbQ99JT1 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GatbQ99JT1 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GatbQ99JT1 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GatbQ99JT1 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GatbQ99JT1 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GatbQ99JT1 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GatbQ99JT1 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GatbQ99JT1 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GatbQ99JT1 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
GatbQ99JT1 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GatbQ99JT1 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GatbQ99JT1 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GatbQ99JT1 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GatbQ99JT1 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GatbQ99JT1 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GatbQ99JT1 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GatbQ99JT1 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GatbQ99JT1 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GatbQ99JT1 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GatbQ99JT1 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GatbQ99JT1 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GatbQ99JT1 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GatbQ99JT1 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GatbQ99JT1 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GatbQ99JT1 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GatbQ99JT1 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GatbQ99JT1 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GatbQ99JT1 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GatbQ99JT1 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GatbQ99JT1 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GatbQ99JT1 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GatbQ99JT1 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GatbQ99JT1 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GatbQ99JT1 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GatbQ99JT1 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GatbQ99JT1 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GatbQ99JT1 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GatbQ99JT1 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GatbQ99JT1 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GatbQ99JT1 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GatbQ99JT1 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GatbQ99JT1 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GatbQ99JT1 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GatbQ99JT1 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GatbQ99JT1 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GatbQ99JT1 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GatbQ99JT1 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GatbQ99JT1 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GatbQ99JT1 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GatbQ99JT1 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GatbQ99JT1 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GatbQ99JT1 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GatbQ99JT1 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GatbQ99JT1 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GatbQ99JT1 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GatbQ99JT1 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GatbQ99JT1 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GatbQ99JT1 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GatbQ99JT1 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GatbQ99JT1 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GatbQ99JT1 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GatbQ99JT1 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GatbQ99JT1 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GatbQ99JT1 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms