Protein–RNA interactions for Protein: Q925E8

Sptssb, Serine palmitoyltransferase small subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 76 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptssbQ925E8 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC9.08□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.08□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC9.07□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC9.07□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms