Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZZ3

Sncb, Beta-synuclein, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SncbQ91ZZ3 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SncbQ91ZZ3 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SncbQ91ZZ3 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SncbQ91ZZ3 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SncbQ91ZZ3 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SncbQ91ZZ3 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SncbQ91ZZ3 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SncbQ91ZZ3 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SncbQ91ZZ3 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SncbQ91ZZ3 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SncbQ91ZZ3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SncbQ91ZZ3 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SncbQ91ZZ3 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SncbQ91ZZ3 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SncbQ91ZZ3 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SncbQ91ZZ3 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SncbQ91ZZ3 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SncbQ91ZZ3 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SncbQ91ZZ3 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SncbQ91ZZ3 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SncbQ91ZZ3 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SncbQ91ZZ3 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SncbQ91ZZ3 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SncbQ91ZZ3 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SncbQ91ZZ3 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SncbQ91ZZ3 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SncbQ91ZZ3 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SncbQ91ZZ3 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SncbQ91ZZ3 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SncbQ91ZZ3 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SncbQ91ZZ3 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SncbQ91ZZ3 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SncbQ91ZZ3 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SncbQ91ZZ3 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SncbQ91ZZ3 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SncbQ91ZZ3 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SncbQ91ZZ3 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SncbQ91ZZ3 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SncbQ91ZZ3 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SncbQ91ZZ3 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SncbQ91ZZ3 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SncbQ91ZZ3 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SncbQ91ZZ3 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SncbQ91ZZ3 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SncbQ91ZZ3 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SncbQ91ZZ3 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SncbQ91ZZ3 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SncbQ91ZZ3 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SncbQ91ZZ3 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SncbQ91ZZ3 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SncbQ91ZZ3 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SncbQ91ZZ3 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SncbQ91ZZ3 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SncbQ91ZZ3 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SncbQ91ZZ3 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SncbQ91ZZ3 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SncbQ91ZZ3 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SncbQ91ZZ3 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SncbQ91ZZ3 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SncbQ91ZZ3 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SncbQ91ZZ3 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SncbQ91ZZ3 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SncbQ91ZZ3 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SncbQ91ZZ3 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SncbQ91ZZ3 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SncbQ91ZZ3 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SncbQ91ZZ3 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SncbQ91ZZ3 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SncbQ91ZZ3 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SncbQ91ZZ3 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SncbQ91ZZ3 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SncbQ91ZZ3 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SncbQ91ZZ3 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SncbQ91ZZ3 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SncbQ91ZZ3 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SncbQ91ZZ3 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SncbQ91ZZ3 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SncbQ91ZZ3 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SncbQ91ZZ3 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SncbQ91ZZ3 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SncbQ91ZZ3 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SncbQ91ZZ3 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SncbQ91ZZ3 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SncbQ91ZZ3 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SncbQ91ZZ3 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SncbQ91ZZ3 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SncbQ91ZZ3 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SncbQ91ZZ3 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SncbQ91ZZ3 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SncbQ91ZZ3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SncbQ91ZZ3 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SncbQ91ZZ3 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SncbQ91ZZ3 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SncbQ91ZZ3 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SncbQ91ZZ3 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SncbQ91ZZ3 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SncbQ91ZZ3 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SncbQ91ZZ3 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SncbQ91ZZ3 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SncbQ91ZZ3 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms