Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ5

Rpe65, Retinoid isomerohydrolase, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpe65Q91ZQ5 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpe65Q91ZQ5 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpe65Q91ZQ5 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpe65Q91ZQ5 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpe65Q91ZQ5 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpe65Q91ZQ5 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpe65Q91ZQ5 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpe65Q91ZQ5 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpe65Q91ZQ5 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpe65Q91ZQ5 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpe65Q91ZQ5 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rpe65Q91ZQ5 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpe65Q91ZQ5 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpe65Q91ZQ5 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpe65Q91ZQ5 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpe65Q91ZQ5 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpe65Q91ZQ5 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpe65Q91ZQ5 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpe65Q91ZQ5 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpe65Q91ZQ5 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpe65Q91ZQ5 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpe65Q91ZQ5 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpe65Q91ZQ5 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpe65Q91ZQ5 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpe65Q91ZQ5 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpe65Q91ZQ5 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpe65Q91ZQ5 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpe65Q91ZQ5 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpe65Q91ZQ5 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpe65Q91ZQ5 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpe65Q91ZQ5 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpe65Q91ZQ5 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpe65Q91ZQ5 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpe65Q91ZQ5 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpe65Q91ZQ5 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpe65Q91ZQ5 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpe65Q91ZQ5 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpe65Q91ZQ5 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpe65Q91ZQ5 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpe65Q91ZQ5 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpe65Q91ZQ5 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpe65Q91ZQ5 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpe65Q91ZQ5 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpe65Q91ZQ5 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpe65Q91ZQ5 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpe65Q91ZQ5 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpe65Q91ZQ5 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpe65Q91ZQ5 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpe65Q91ZQ5 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpe65Q91ZQ5 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpe65Q91ZQ5 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpe65Q91ZQ5 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpe65Q91ZQ5 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpe65Q91ZQ5 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rpe65Q91ZQ5 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpe65Q91ZQ5 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpe65Q91ZQ5 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpe65Q91ZQ5 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpe65Q91ZQ5 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpe65Q91ZQ5 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpe65Q91ZQ5 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpe65Q91ZQ5 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpe65Q91ZQ5 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpe65Q91ZQ5 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpe65Q91ZQ5 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpe65Q91ZQ5 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpe65Q91ZQ5 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpe65Q91ZQ5 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpe65Q91ZQ5 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpe65Q91ZQ5 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpe65Q91ZQ5 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpe65Q91ZQ5 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpe65Q91ZQ5 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpe65Q91ZQ5 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpe65Q91ZQ5 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rpe65Q91ZQ5 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpe65Q91ZQ5 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpe65Q91ZQ5 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpe65Q91ZQ5 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpe65Q91ZQ5 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpe65Q91ZQ5 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpe65Q91ZQ5 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpe65Q91ZQ5 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpe65Q91ZQ5 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpe65Q91ZQ5 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpe65Q91ZQ5 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpe65Q91ZQ5 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpe65Q91ZQ5 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpe65Q91ZQ5 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpe65Q91ZQ5 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpe65Q91ZQ5 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpe65Q91ZQ5 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpe65Q91ZQ5 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpe65Q91ZQ5 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpe65Q91ZQ5 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpe65Q91ZQ5 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpe65Q91ZQ5 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpe65Q91ZQ5 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpe65Q91ZQ5 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpe65Q91ZQ5 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms