Protein–RNA interactions for Protein: Q91YK8

Lypd3, Ly6/PLAUR domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lypd3Q91YK8 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lypd3Q91YK8 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lypd3Q91YK8 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lypd3Q91YK8 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lypd3Q91YK8 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lypd3Q91YK8 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lypd3Q91YK8 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lypd3Q91YK8 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lypd3Q91YK8 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lypd3Q91YK8 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lypd3Q91YK8 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lypd3Q91YK8 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lypd3Q91YK8 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lypd3Q91YK8 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lypd3Q91YK8 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lypd3Q91YK8 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lypd3Q91YK8 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lypd3Q91YK8 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lypd3Q91YK8 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lypd3Q91YK8 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lypd3Q91YK8 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Lypd3Q91YK8 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Lypd3Q91YK8 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Lypd3Q91YK8 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Lypd3Q91YK8 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lypd3Q91YK8 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lypd3Q91YK8 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lypd3Q91YK8 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Lypd3Q91YK8 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Lypd3Q91YK8 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lypd3Q91YK8 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lypd3Q91YK8 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lypd3Q91YK8 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lypd3Q91YK8 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lypd3Q91YK8 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lypd3Q91YK8 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lypd3Q91YK8 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lypd3Q91YK8 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lypd3Q91YK8 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lypd3Q91YK8 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lypd3Q91YK8 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lypd3Q91YK8 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lypd3Q91YK8 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lypd3Q91YK8 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lypd3Q91YK8 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lypd3Q91YK8 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lypd3Q91YK8 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lypd3Q91YK8 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lypd3Q91YK8 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lypd3Q91YK8 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lypd3Q91YK8 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lypd3Q91YK8 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lypd3Q91YK8 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Lypd3Q91YK8 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Lypd3Q91YK8 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lypd3Q91YK8 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lypd3Q91YK8 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Lypd3Q91YK8 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lypd3Q91YK8 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lypd3Q91YK8 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Lypd3Q91YK8 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Lypd3Q91YK8 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Lypd3Q91YK8 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lypd3Q91YK8 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Lypd3Q91YK8 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lypd3Q91YK8 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lypd3Q91YK8 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lypd3Q91YK8 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Lypd3Q91YK8 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Lypd3Q91YK8 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lypd3Q91YK8 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lypd3Q91YK8 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lypd3Q91YK8 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lypd3Q91YK8 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lypd3Q91YK8 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lypd3Q91YK8 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lypd3Q91YK8 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lypd3Q91YK8 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Lypd3Q91YK8 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Lypd3Q91YK8 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lypd3Q91YK8 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lypd3Q91YK8 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lypd3Q91YK8 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lypd3Q91YK8 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lypd3Q91YK8 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Lypd3Q91YK8 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lypd3Q91YK8 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lypd3Q91YK8 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lypd3Q91YK8 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lypd3Q91YK8 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Lypd3Q91YK8 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Lypd3Q91YK8 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lypd3Q91YK8 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lypd3Q91YK8 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lypd3Q91YK8 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lypd3Q91YK8 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lypd3Q91YK8 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Lypd3Q91YK8 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lypd3Q91YK8 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lypd3Q91YK8 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms