Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDF2

Uhrf1, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 782 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1Q8VDF2 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Uhrf1Q8VDF2 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Uhrf1Q8VDF2 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uhrf1Q8VDF2 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uhrf1Q8VDF2 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uhrf1Q8VDF2 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uhrf1Q8VDF2 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uhrf1Q8VDF2 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uhrf1Q8VDF2 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uhrf1Q8VDF2 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uhrf1Q8VDF2 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uhrf1Q8VDF2 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uhrf1Q8VDF2 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uhrf1Q8VDF2 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uhrf1Q8VDF2 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Uhrf1Q8VDF2 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uhrf1Q8VDF2 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uhrf1Q8VDF2 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uhrf1Q8VDF2 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uhrf1Q8VDF2 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uhrf1Q8VDF2 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Uhrf1Q8VDF2 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uhrf1Q8VDF2 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uhrf1Q8VDF2 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uhrf1Q8VDF2 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uhrf1Q8VDF2 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uhrf1Q8VDF2 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Uhrf1Q8VDF2 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uhrf1Q8VDF2 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uhrf1Q8VDF2 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uhrf1Q8VDF2 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uhrf1Q8VDF2 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uhrf1Q8VDF2 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uhrf1Q8VDF2 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uhrf1Q8VDF2 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uhrf1Q8VDF2 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uhrf1Q8VDF2 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Uhrf1Q8VDF2 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uhrf1Q8VDF2 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uhrf1Q8VDF2 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uhrf1Q8VDF2 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uhrf1Q8VDF2 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uhrf1Q8VDF2 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uhrf1Q8VDF2 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uhrf1Q8VDF2 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uhrf1Q8VDF2 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uhrf1Q8VDF2 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uhrf1Q8VDF2 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uhrf1Q8VDF2 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uhrf1Q8VDF2 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uhrf1Q8VDF2 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uhrf1Q8VDF2 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Uhrf1Q8VDF2 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uhrf1Q8VDF2 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uhrf1Q8VDF2 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uhrf1Q8VDF2 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uhrf1Q8VDF2 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uhrf1Q8VDF2 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uhrf1Q8VDF2 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uhrf1Q8VDF2 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uhrf1Q8VDF2 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Uhrf1Q8VDF2 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Uhrf1Q8VDF2 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uhrf1Q8VDF2 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uhrf1Q8VDF2 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uhrf1Q8VDF2 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Uhrf1Q8VDF2 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uhrf1Q8VDF2 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uhrf1Q8VDF2 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uhrf1Q8VDF2 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uhrf1Q8VDF2 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uhrf1Q8VDF2 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uhrf1Q8VDF2 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uhrf1Q8VDF2 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uhrf1Q8VDF2 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uhrf1Q8VDF2 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uhrf1Q8VDF2 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Uhrf1Q8VDF2 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uhrf1Q8VDF2 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uhrf1Q8VDF2 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uhrf1Q8VDF2 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uhrf1Q8VDF2 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uhrf1Q8VDF2 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uhrf1Q8VDF2 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uhrf1Q8VDF2 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uhrf1Q8VDF2 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uhrf1Q8VDF2 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uhrf1Q8VDF2 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uhrf1Q8VDF2 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uhrf1Q8VDF2 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uhrf1Q8VDF2 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uhrf1Q8VDF2 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uhrf1Q8VDF2 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Uhrf1Q8VDF2 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
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