Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC56

Rnf8, E3 ubiquitin-protein ligase RNF8, mousemouse

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Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf8Q8VC56 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Rnf8Q8VC56 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf8Q8VC56 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf8Q8VC56 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf8Q8VC56 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf8Q8VC56 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf8Q8VC56 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf8Q8VC56 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf8Q8VC56 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf8Q8VC56 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf8Q8VC56 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf8Q8VC56 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf8Q8VC56 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf8Q8VC56 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf8Q8VC56 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf8Q8VC56 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf8Q8VC56 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf8Q8VC56 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf8Q8VC56 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf8Q8VC56 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf8Q8VC56 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf8Q8VC56 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf8Q8VC56 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf8Q8VC56 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf8Q8VC56 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf8Q8VC56 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf8Q8VC56 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf8Q8VC56 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf8Q8VC56 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf8Q8VC56 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf8Q8VC56 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf8Q8VC56 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf8Q8VC56 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf8Q8VC56 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf8Q8VC56 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf8Q8VC56 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf8Q8VC56 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf8Q8VC56 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf8Q8VC56 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf8Q8VC56 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf8Q8VC56 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf8Q8VC56 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf8Q8VC56 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf8Q8VC56 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf8Q8VC56 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf8Q8VC56 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf8Q8VC56 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf8Q8VC56 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf8Q8VC56 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf8Q8VC56 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf8Q8VC56 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf8Q8VC56 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf8Q8VC56 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf8Q8VC56 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf8Q8VC56 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf8Q8VC56 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf8Q8VC56 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf8Q8VC56 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf8Q8VC56 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf8Q8VC56 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf8Q8VC56 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf8Q8VC56 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf8Q8VC56 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf8Q8VC56 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf8Q8VC56 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Rnf8Q8VC56 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf8Q8VC56 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf8Q8VC56 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf8Q8VC56 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf8Q8VC56 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf8Q8VC56 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf8Q8VC56 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf8Q8VC56 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf8Q8VC56 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf8Q8VC56 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf8Q8VC56 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf8Q8VC56 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf8Q8VC56 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf8Q8VC56 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf8Q8VC56 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf8Q8VC56 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf8Q8VC56 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf8Q8VC56 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf8Q8VC56 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf8Q8VC56 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf8Q8VC56 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf8Q8VC56 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf8Q8VC56 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf8Q8VC56 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf8Q8VC56 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf8Q8VC56 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf8Q8VC56 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf8Q8VC56 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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