Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hpf1Q8CFE2 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hpf1Q8CFE2 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hpf1Q8CFE2 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hpf1Q8CFE2 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hpf1Q8CFE2 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hpf1Q8CFE2 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hpf1Q8CFE2 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hpf1Q8CFE2 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hpf1Q8CFE2 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hpf1Q8CFE2 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hpf1Q8CFE2 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Hpf1Q8CFE2 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hpf1Q8CFE2 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hpf1Q8CFE2 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hpf1Q8CFE2 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hpf1Q8CFE2 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hpf1Q8CFE2 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hpf1Q8CFE2 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hpf1Q8CFE2 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hpf1Q8CFE2 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hpf1Q8CFE2 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hpf1Q8CFE2 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hpf1Q8CFE2 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hpf1Q8CFE2 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Hpf1Q8CFE2 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hpf1Q8CFE2 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hpf1Q8CFE2 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hpf1Q8CFE2 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hpf1Q8CFE2 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hpf1Q8CFE2 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hpf1Q8CFE2 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hpf1Q8CFE2 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hpf1Q8CFE2 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hpf1Q8CFE2 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hpf1Q8CFE2 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hpf1Q8CFE2 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hpf1Q8CFE2 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hpf1Q8CFE2 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hpf1Q8CFE2 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hpf1Q8CFE2 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hpf1Q8CFE2 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hpf1Q8CFE2 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hpf1Q8CFE2 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hpf1Q8CFE2 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hpf1Q8CFE2 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hpf1Q8CFE2 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hpf1Q8CFE2 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hpf1Q8CFE2 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hpf1Q8CFE2 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hpf1Q8CFE2 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hpf1Q8CFE2 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hpf1Q8CFE2 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hpf1Q8CFE2 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hpf1Q8CFE2 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hpf1Q8CFE2 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Hpf1Q8CFE2 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hpf1Q8CFE2 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hpf1Q8CFE2 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hpf1Q8CFE2 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hpf1Q8CFE2 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hpf1Q8CFE2 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hpf1Q8CFE2 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hpf1Q8CFE2 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hpf1Q8CFE2 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hpf1Q8CFE2 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hpf1Q8CFE2 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hpf1Q8CFE2 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Hpf1Q8CFE2 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hpf1Q8CFE2 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Hpf1Q8CFE2 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Hpf1Q8CFE2 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hpf1Q8CFE2 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Hpf1Q8CFE2 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hpf1Q8CFE2 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hpf1Q8CFE2 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hpf1Q8CFE2 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hpf1Q8CFE2 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hpf1Q8CFE2 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hpf1Q8CFE2 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Hpf1Q8CFE2 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hpf1Q8CFE2 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hpf1Q8CFE2 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hpf1Q8CFE2 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hpf1Q8CFE2 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hpf1Q8CFE2 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hpf1Q8CFE2 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hpf1Q8CFE2 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hpf1Q8CFE2 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hpf1Q8CFE2 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hpf1Q8CFE2 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hpf1Q8CFE2 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hpf1Q8CFE2 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
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