Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWQ6

UPF0505 protein C16orf62 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 963 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BWQ6 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8BWQ6 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8BWQ6 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8BWQ6 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8BWQ6 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8BWQ6 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8BWQ6 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8BWQ6 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8BWQ6 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8BWQ6 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8BWQ6 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8BWQ6 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8BWQ6 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Q8BWQ6 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Q8BWQ6 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Q8BWQ6 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Q8BWQ6 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Q8BWQ6 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Q8BWQ6 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Q8BWQ6 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Q8BWQ6 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Q8BWQ6 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Q8BWQ6 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Q8BWQ6 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Q8BWQ6 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8BWQ6 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8BWQ6 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8BWQ6 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8BWQ6 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8BWQ6 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8BWQ6 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8BWQ6 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8BWQ6 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8BWQ6 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8BWQ6 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8BWQ6 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8BWQ6 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8BWQ6 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8BWQ6 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8BWQ6 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8BWQ6 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8BWQ6 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8BWQ6 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8BWQ6 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8BWQ6 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8BWQ6 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8BWQ6 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8BWQ6 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8BWQ6 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8BWQ6 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q8BWQ6 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8BWQ6 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8BWQ6 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8BWQ6 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8BWQ6 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8BWQ6 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8BWQ6 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8BWQ6 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8BWQ6 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8BWQ6 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8BWQ6 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8BWQ6 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8BWQ6 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8BWQ6 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8BWQ6 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8BWQ6 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8BWQ6 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8BWQ6 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8BWQ6 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8BWQ6 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8BWQ6 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8BWQ6 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8BWQ6 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8BWQ6 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8BWQ6 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8BWQ6 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8BWQ6 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8BWQ6 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8BWQ6 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8BWQ6 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8BWQ6 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8BWQ6 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8BWQ6 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8BWQ6 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8BWQ6 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q8BWQ6 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8BWQ6 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8BWQ6 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8BWQ6 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8BWQ6 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8BWQ6 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8BWQ6 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8BWQ6 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8BWQ6 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8BWQ6 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8BWQ6 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8BWQ6 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8BWQ6 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8BWQ6 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q8BWQ6 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms