Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pggt1bQ8BUY9 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pggt1bQ8BUY9 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pggt1bQ8BUY9 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pggt1bQ8BUY9 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pggt1bQ8BUY9 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pggt1bQ8BUY9 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Pggt1bQ8BUY9 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Pggt1bQ8BUY9 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Pggt1bQ8BUY9 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Pggt1bQ8BUY9 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pggt1bQ8BUY9 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pggt1bQ8BUY9 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pggt1bQ8BUY9 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pggt1bQ8BUY9 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pggt1bQ8BUY9 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pggt1bQ8BUY9 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pggt1bQ8BUY9 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pggt1bQ8BUY9 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pggt1bQ8BUY9 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pggt1bQ8BUY9 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pggt1bQ8BUY9 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pggt1bQ8BUY9 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pggt1bQ8BUY9 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pggt1bQ8BUY9 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pggt1bQ8BUY9 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Pggt1bQ8BUY9 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pggt1bQ8BUY9 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pggt1bQ8BUY9 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pggt1bQ8BUY9 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pggt1bQ8BUY9 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pggt1bQ8BUY9 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pggt1bQ8BUY9 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pggt1bQ8BUY9 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pggt1bQ8BUY9 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pggt1bQ8BUY9 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pggt1bQ8BUY9 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pggt1bQ8BUY9 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Pggt1bQ8BUY9 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pggt1bQ8BUY9 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pggt1bQ8BUY9 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pggt1bQ8BUY9 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pggt1bQ8BUY9 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pggt1bQ8BUY9 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pggt1bQ8BUY9 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pggt1bQ8BUY9 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Pggt1bQ8BUY9 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pggt1bQ8BUY9 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pggt1bQ8BUY9 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pggt1bQ8BUY9 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pggt1bQ8BUY9 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pggt1bQ8BUY9 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pggt1bQ8BUY9 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pggt1bQ8BUY9 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Pggt1bQ8BUY9 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Pggt1bQ8BUY9 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pggt1bQ8BUY9 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pggt1bQ8BUY9 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pggt1bQ8BUY9 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pggt1bQ8BUY9 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pggt1bQ8BUY9 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pggt1bQ8BUY9 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pggt1bQ8BUY9 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pggt1bQ8BUY9 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pggt1bQ8BUY9 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pggt1bQ8BUY9 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pggt1bQ8BUY9 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pggt1bQ8BUY9 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pggt1bQ8BUY9 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Pggt1bQ8BUY9 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pggt1bQ8BUY9 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pggt1bQ8BUY9 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pggt1bQ8BUY9 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pggt1bQ8BUY9 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pggt1bQ8BUY9 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pggt1bQ8BUY9 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pggt1bQ8BUY9 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pggt1bQ8BUY9 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Pggt1bQ8BUY9 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Pggt1bQ8BUY9 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pggt1bQ8BUY9 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pggt1bQ8BUY9 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pggt1bQ8BUY9 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pggt1bQ8BUY9 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pggt1bQ8BUY9 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pggt1bQ8BUY9 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pggt1bQ8BUY9 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pggt1bQ8BUY9 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pggt1bQ8BUY9 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pggt1bQ8BUY9 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pggt1bQ8BUY9 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pggt1bQ8BUY9 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pggt1bQ8BUY9 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Pggt1bQ8BUY9 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pggt1bQ8BUY9 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pggt1bQ8BUY9 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pggt1bQ8BUY9 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pggt1bQ8BUY9 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pggt1bQ8BUY9 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Pggt1bQ8BUY9 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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