Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKN5

Tubgcp5, Gamma-tubulin complex component 5, mousemouse

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Length 1,024 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp5Q8BKN5 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubgcp5Q8BKN5 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubgcp5Q8BKN5 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubgcp5Q8BKN5 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubgcp5Q8BKN5 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubgcp5Q8BKN5 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubgcp5Q8BKN5 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubgcp5Q8BKN5 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubgcp5Q8BKN5 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubgcp5Q8BKN5 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubgcp5Q8BKN5 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubgcp5Q8BKN5 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubgcp5Q8BKN5 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubgcp5Q8BKN5 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubgcp5Q8BKN5 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubgcp5Q8BKN5 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubgcp5Q8BKN5 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tubgcp5Q8BKN5 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tubgcp5Q8BKN5 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tubgcp5Q8BKN5 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tubgcp5Q8BKN5 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tubgcp5Q8BKN5 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tubgcp5Q8BKN5 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tubgcp5Q8BKN5 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tubgcp5Q8BKN5 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tubgcp5Q8BKN5 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Tubgcp5Q8BKN5 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tubgcp5Q8BKN5 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tubgcp5Q8BKN5 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tubgcp5Q8BKN5 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tubgcp5Q8BKN5 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Tubgcp5Q8BKN5 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Tubgcp5Q8BKN5 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tubgcp5Q8BKN5 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubgcp5Q8BKN5 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubgcp5Q8BKN5 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubgcp5Q8BKN5 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubgcp5Q8BKN5 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubgcp5Q8BKN5 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Tubgcp5Q8BKN5 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubgcp5Q8BKN5 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubgcp5Q8BKN5 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubgcp5Q8BKN5 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tubgcp5Q8BKN5 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubgcp5Q8BKN5 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubgcp5Q8BKN5 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubgcp5Q8BKN5 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubgcp5Q8BKN5 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubgcp5Q8BKN5 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubgcp5Q8BKN5 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubgcp5Q8BKN5 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubgcp5Q8BKN5 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubgcp5Q8BKN5 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubgcp5Q8BKN5 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubgcp5Q8BKN5 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubgcp5Q8BKN5 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubgcp5Q8BKN5 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubgcp5Q8BKN5 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tubgcp5Q8BKN5 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Tubgcp5Q8BKN5 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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