Protein–RNA interactions for Protein: Q76N33

Stambpl1, AMSH-like protease, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stambpl1Q76N33 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stambpl1Q76N33 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stambpl1Q76N33 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stambpl1Q76N33 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stambpl1Q76N33 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stambpl1Q76N33 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stambpl1Q76N33 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Stambpl1Q76N33 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stambpl1Q76N33 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stambpl1Q76N33 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stambpl1Q76N33 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stambpl1Q76N33 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stambpl1Q76N33 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stambpl1Q76N33 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stambpl1Q76N33 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stambpl1Q76N33 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stambpl1Q76N33 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stambpl1Q76N33 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stambpl1Q76N33 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Stambpl1Q76N33 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stambpl1Q76N33 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stambpl1Q76N33 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stambpl1Q76N33 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stambpl1Q76N33 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Stambpl1Q76N33 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stambpl1Q76N33 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stambpl1Q76N33 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Stambpl1Q76N33 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Stambpl1Q76N33 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Stambpl1Q76N33 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stambpl1Q76N33 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stambpl1Q76N33 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stambpl1Q76N33 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Stambpl1Q76N33 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Stambpl1Q76N33 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stambpl1Q76N33 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stambpl1Q76N33 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stambpl1Q76N33 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stambpl1Q76N33 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stambpl1Q76N33 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stambpl1Q76N33 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stambpl1Q76N33 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stambpl1Q76N33 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Stambpl1Q76N33 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stambpl1Q76N33 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stambpl1Q76N33 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stambpl1Q76N33 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stambpl1Q76N33 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stambpl1Q76N33 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stambpl1Q76N33 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stambpl1Q76N33 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stambpl1Q76N33 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stambpl1Q76N33 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stambpl1Q76N33 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stambpl1Q76N33 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stambpl1Q76N33 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stambpl1Q76N33 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stambpl1Q76N33 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stambpl1Q76N33 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stambpl1Q76N33 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stambpl1Q76N33 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stambpl1Q76N33 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stambpl1Q76N33 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stambpl1Q76N33 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stambpl1Q76N33 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stambpl1Q76N33 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stambpl1Q76N33 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Stambpl1Q76N33 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stambpl1Q76N33 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stambpl1Q76N33 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stambpl1Q76N33 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stambpl1Q76N33 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stambpl1Q76N33 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stambpl1Q76N33 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stambpl1Q76N33 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stambpl1Q76N33 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stambpl1Q76N33 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stambpl1Q76N33 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stambpl1Q76N33 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stambpl1Q76N33 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stambpl1Q76N33 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stambpl1Q76N33 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stambpl1Q76N33 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stambpl1Q76N33 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stambpl1Q76N33 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Stambpl1Q76N33 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stambpl1Q76N33 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stambpl1Q76N33 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stambpl1Q76N33 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stambpl1Q76N33 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stambpl1Q76N33 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stambpl1Q76N33 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stambpl1Q76N33 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stambpl1Q76N33 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stambpl1Q76N33 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stambpl1Q76N33 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Stambpl1Q76N33 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Stambpl1Q76N33 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stambpl1Q76N33 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Stambpl1Q76N33 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms