Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFF0

Scaf4, SR-related CTD-associated factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf4Q6PFF0 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Scaf4Q6PFF0 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scaf4Q6PFF0 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scaf4Q6PFF0 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scaf4Q6PFF0 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scaf4Q6PFF0 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scaf4Q6PFF0 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Scaf4Q6PFF0 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scaf4Q6PFF0 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scaf4Q6PFF0 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scaf4Q6PFF0 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scaf4Q6PFF0 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scaf4Q6PFF0 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scaf4Q6PFF0 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scaf4Q6PFF0 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scaf4Q6PFF0 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scaf4Q6PFF0 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scaf4Q6PFF0 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scaf4Q6PFF0 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scaf4Q6PFF0 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scaf4Q6PFF0 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scaf4Q6PFF0 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scaf4Q6PFF0 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scaf4Q6PFF0 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scaf4Q6PFF0 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scaf4Q6PFF0 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scaf4Q6PFF0 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scaf4Q6PFF0 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scaf4Q6PFF0 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scaf4Q6PFF0 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scaf4Q6PFF0 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scaf4Q6PFF0 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scaf4Q6PFF0 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scaf4Q6PFF0 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Scaf4Q6PFF0 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scaf4Q6PFF0 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scaf4Q6PFF0 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scaf4Q6PFF0 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scaf4Q6PFF0 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scaf4Q6PFF0 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scaf4Q6PFF0 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scaf4Q6PFF0 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scaf4Q6PFF0 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scaf4Q6PFF0 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scaf4Q6PFF0 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scaf4Q6PFF0 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scaf4Q6PFF0 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scaf4Q6PFF0 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scaf4Q6PFF0 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scaf4Q6PFF0 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scaf4Q6PFF0 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scaf4Q6PFF0 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scaf4Q6PFF0 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scaf4Q6PFF0 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scaf4Q6PFF0 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scaf4Q6PFF0 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scaf4Q6PFF0 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scaf4Q6PFF0 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scaf4Q6PFF0 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scaf4Q6PFF0 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scaf4Q6PFF0 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Scaf4Q6PFF0 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scaf4Q6PFF0 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scaf4Q6PFF0 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scaf4Q6PFF0 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Scaf4Q6PFF0 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scaf4Q6PFF0 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scaf4Q6PFF0 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scaf4Q6PFF0 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scaf4Q6PFF0 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scaf4Q6PFF0 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scaf4Q6PFF0 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Scaf4Q6PFF0 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scaf4Q6PFF0 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scaf4Q6PFF0 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scaf4Q6PFF0 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scaf4Q6PFF0 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scaf4Q6PFF0 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scaf4Q6PFF0 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scaf4Q6PFF0 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scaf4Q6PFF0 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scaf4Q6PFF0 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scaf4Q6PFF0 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scaf4Q6PFF0 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scaf4Q6PFF0 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scaf4Q6PFF0 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scaf4Q6PFF0 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scaf4Q6PFF0 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scaf4Q6PFF0 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scaf4Q6PFF0 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scaf4Q6PFF0 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scaf4Q6PFF0 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scaf4Q6PFF0 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scaf4Q6PFF0 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scaf4Q6PFF0 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scaf4Q6PFF0 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scaf4Q6PFF0 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Scaf4Q6PFF0 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scaf4Q6PFF0 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scaf4Q6PFF0 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms