Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDJ1

Cachd1, VWFA and cache domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cachd1Q6PDJ1 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cachd1Q6PDJ1 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cachd1Q6PDJ1 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cachd1Q6PDJ1 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cachd1Q6PDJ1 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cachd1Q6PDJ1 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cachd1Q6PDJ1 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cachd1Q6PDJ1 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cachd1Q6PDJ1 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cachd1Q6PDJ1 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cachd1Q6PDJ1 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cachd1Q6PDJ1 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cachd1Q6PDJ1 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cachd1Q6PDJ1 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cachd1Q6PDJ1 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cachd1Q6PDJ1 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cachd1Q6PDJ1 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cachd1Q6PDJ1 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cachd1Q6PDJ1 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cachd1Q6PDJ1 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cachd1Q6PDJ1 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cachd1Q6PDJ1 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cachd1Q6PDJ1 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cachd1Q6PDJ1 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cachd1Q6PDJ1 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cachd1Q6PDJ1 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cachd1Q6PDJ1 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cachd1Q6PDJ1 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cachd1Q6PDJ1 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cachd1Q6PDJ1 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cachd1Q6PDJ1 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cachd1Q6PDJ1 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cachd1Q6PDJ1 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cachd1Q6PDJ1 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cachd1Q6PDJ1 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cachd1Q6PDJ1 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cachd1Q6PDJ1 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cachd1Q6PDJ1 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cachd1Q6PDJ1 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cachd1Q6PDJ1 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cachd1Q6PDJ1 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cachd1Q6PDJ1 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cachd1Q6PDJ1 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cachd1Q6PDJ1 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cachd1Q6PDJ1 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cachd1Q6PDJ1 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cachd1Q6PDJ1 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cachd1Q6PDJ1 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cachd1Q6PDJ1 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cachd1Q6PDJ1 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cachd1Q6PDJ1 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cachd1Q6PDJ1 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cachd1Q6PDJ1 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cachd1Q6PDJ1 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cachd1Q6PDJ1 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cachd1Q6PDJ1 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cachd1Q6PDJ1 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cachd1Q6PDJ1 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cachd1Q6PDJ1 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cachd1Q6PDJ1 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cachd1Q6PDJ1 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cachd1Q6PDJ1 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cachd1Q6PDJ1 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cachd1Q6PDJ1 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cachd1Q6PDJ1 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cachd1Q6PDJ1 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cachd1Q6PDJ1 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cachd1Q6PDJ1 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cachd1Q6PDJ1 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cachd1Q6PDJ1 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cachd1Q6PDJ1 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cachd1Q6PDJ1 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cachd1Q6PDJ1 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cachd1Q6PDJ1 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cachd1Q6PDJ1 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cachd1Q6PDJ1 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cachd1Q6PDJ1 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cachd1Q6PDJ1 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cachd1Q6PDJ1 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cachd1Q6PDJ1 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cachd1Q6PDJ1 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cachd1Q6PDJ1 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cachd1Q6PDJ1 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cachd1Q6PDJ1 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cachd1Q6PDJ1 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Cachd1Q6PDJ1 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cachd1Q6PDJ1 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cachd1Q6PDJ1 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cachd1Q6PDJ1 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cachd1Q6PDJ1 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cachd1Q6PDJ1 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cachd1Q6PDJ1 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cachd1Q6PDJ1 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Cachd1Q6PDJ1 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cachd1Q6PDJ1 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cachd1Q6PDJ1 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Cachd1Q6PDJ1 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cachd1Q6PDJ1 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cachd1Q6PDJ1 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cachd1Q6PDJ1 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms