Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS46

Pdcd11, Protein RRP5 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd11Q6NS46 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pdcd11Q6NS46 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pdcd11Q6NS46 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pdcd11Q6NS46 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pdcd11Q6NS46 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pdcd11Q6NS46 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pdcd11Q6NS46 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pdcd11Q6NS46 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pdcd11Q6NS46 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Pdcd11Q6NS46 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pdcd11Q6NS46 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pdcd11Q6NS46 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pdcd11Q6NS46 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pdcd11Q6NS46 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pdcd11Q6NS46 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pdcd11Q6NS46 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pdcd11Q6NS46 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pdcd11Q6NS46 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Pdcd11Q6NS46 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Pdcd11Q6NS46 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pdcd11Q6NS46 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pdcd11Q6NS46 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pdcd11Q6NS46 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pdcd11Q6NS46 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pdcd11Q6NS46 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pdcd11Q6NS46 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pdcd11Q6NS46 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pdcd11Q6NS46 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pdcd11Q6NS46 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pdcd11Q6NS46 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pdcd11Q6NS46 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pdcd11Q6NS46 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pdcd11Q6NS46 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pdcd11Q6NS46 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pdcd11Q6NS46 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pdcd11Q6NS46 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pdcd11Q6NS46 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pdcd11Q6NS46 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pdcd11Q6NS46 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pdcd11Q6NS46 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pdcd11Q6NS46 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pdcd11Q6NS46 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pdcd11Q6NS46 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pdcd11Q6NS46 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pdcd11Q6NS46 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pdcd11Q6NS46 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pdcd11Q6NS46 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pdcd11Q6NS46 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pdcd11Q6NS46 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pdcd11Q6NS46 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pdcd11Q6NS46 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pdcd11Q6NS46 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pdcd11Q6NS46 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pdcd11Q6NS46 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pdcd11Q6NS46 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Pdcd11Q6NS46 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pdcd11Q6NS46 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pdcd11Q6NS46 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pdcd11Q6NS46 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pdcd11Q6NS46 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Pdcd11Q6NS46 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Pdcd11Q6NS46 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pdcd11Q6NS46 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pdcd11Q6NS46 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pdcd11Q6NS46 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pdcd11Q6NS46 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pdcd11Q6NS46 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pdcd11Q6NS46 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pdcd11Q6NS46 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pdcd11Q6NS46 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pdcd11Q6NS46 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pdcd11Q6NS46 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Pdcd11Q6NS46 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pdcd11Q6NS46 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Pdcd11Q6NS46 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pdcd11Q6NS46 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pdcd11Q6NS46 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pdcd11Q6NS46 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pdcd11Q6NS46 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pdcd11Q6NS46 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pdcd11Q6NS46 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pdcd11Q6NS46 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pdcd11Q6NS46 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pdcd11Q6NS46 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pdcd11Q6NS46 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pdcd11Q6NS46 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pdcd11Q6NS46 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pdcd11Q6NS46 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pdcd11Q6NS46 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pdcd11Q6NS46 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pdcd11Q6NS46 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pdcd11Q6NS46 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pdcd11Q6NS46 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pdcd11Q6NS46 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pdcd11Q6NS46 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pdcd11Q6NS46 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pdcd11Q6NS46 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pdcd11Q6NS46 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pdcd11Q6NS46 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pdcd11Q6NS46 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80 ms