Protein–RNA interactions for Protein: Q66JY2

Ino80d, INO80 complex subunit D, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80dQ66JY2 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ino80dQ66JY2 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ino80dQ66JY2 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ino80dQ66JY2 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ino80dQ66JY2 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ino80dQ66JY2 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ino80dQ66JY2 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ino80dQ66JY2 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ino80dQ66JY2 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ino80dQ66JY2 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ino80dQ66JY2 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ino80dQ66JY2 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ino80dQ66JY2 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ino80dQ66JY2 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ino80dQ66JY2 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ino80dQ66JY2 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ino80dQ66JY2 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ino80dQ66JY2 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ino80dQ66JY2 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ino80dQ66JY2 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ino80dQ66JY2 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ino80dQ66JY2 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ino80dQ66JY2 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ino80dQ66JY2 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ino80dQ66JY2 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ino80dQ66JY2 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ino80dQ66JY2 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ino80dQ66JY2 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ino80dQ66JY2 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ino80dQ66JY2 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ino80dQ66JY2 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ino80dQ66JY2 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ino80dQ66JY2 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ino80dQ66JY2 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ino80dQ66JY2 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ino80dQ66JY2 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ino80dQ66JY2 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ino80dQ66JY2 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ino80dQ66JY2 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ino80dQ66JY2 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ino80dQ66JY2 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ino80dQ66JY2 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ino80dQ66JY2 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ino80dQ66JY2 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ino80dQ66JY2 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ino80dQ66JY2 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ino80dQ66JY2 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ino80dQ66JY2 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ino80dQ66JY2 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ino80dQ66JY2 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ino80dQ66JY2 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ino80dQ66JY2 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ino80dQ66JY2 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ino80dQ66JY2 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ino80dQ66JY2 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ino80dQ66JY2 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ino80dQ66JY2 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ino80dQ66JY2 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ino80dQ66JY2 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ino80dQ66JY2 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ino80dQ66JY2 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ino80dQ66JY2 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ino80dQ66JY2 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ino80dQ66JY2 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ino80dQ66JY2 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ino80dQ66JY2 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ino80dQ66JY2 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ino80dQ66JY2 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ino80dQ66JY2 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ino80dQ66JY2 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ino80dQ66JY2 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ino80dQ66JY2 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ino80dQ66JY2 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ino80dQ66JY2 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ino80dQ66JY2 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ino80dQ66JY2 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ino80dQ66JY2 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ino80dQ66JY2 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ino80dQ66JY2 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ino80dQ66JY2 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ino80dQ66JY2 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ino80dQ66JY2 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ino80dQ66JY2 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ino80dQ66JY2 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ino80dQ66JY2 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ino80dQ66JY2 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ino80dQ66JY2 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ino80dQ66JY2 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ino80dQ66JY2 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ino80dQ66JY2 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ino80dQ66JY2 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ino80dQ66JY2 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ino80dQ66JY2 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ino80dQ66JY2 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ino80dQ66JY2 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ino80dQ66JY2 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Ino80dQ66JY2 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ino80dQ66JY2 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ino80dQ66JY2 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ino80dQ66JY2 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms