Protein–RNA interactions for Protein: Q62029

Pabpc2, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc2Q62029 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pabpc2Q62029 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pabpc2Q62029 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pabpc2Q62029 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pabpc2Q62029 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pabpc2Q62029 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pabpc2Q62029 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Pabpc2Q62029 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pabpc2Q62029 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pabpc2Q62029 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pabpc2Q62029 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pabpc2Q62029 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pabpc2Q62029 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pabpc2Q62029 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Pabpc2Q62029 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pabpc2Q62029 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pabpc2Q62029 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pabpc2Q62029 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Pabpc2Q62029 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Pabpc2Q62029 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pabpc2Q62029 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pabpc2Q62029 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Pabpc2Q62029 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pabpc2Q62029 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pabpc2Q62029 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pabpc2Q62029 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Pabpc2Q62029 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pabpc2Q62029 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pabpc2Q62029 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pabpc2Q62029 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Pabpc2Q62029 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pabpc2Q62029 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pabpc2Q62029 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pabpc2Q62029 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pabpc2Q62029 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Pabpc2Q62029 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pabpc2Q62029 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pabpc2Q62029 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pabpc2Q62029 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Pabpc2Q62029 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pabpc2Q62029 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Pabpc2Q62029 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pabpc2Q62029 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pabpc2Q62029 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pabpc2Q62029 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pabpc2Q62029 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pabpc2Q62029 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pabpc2Q62029 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pabpc2Q62029 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pabpc2Q62029 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pabpc2Q62029 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pabpc2Q62029 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pabpc2Q62029 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pabpc2Q62029 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pabpc2Q62029 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pabpc2Q62029 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pabpc2Q62029 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pabpc2Q62029 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pabpc2Q62029 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pabpc2Q62029 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pabpc2Q62029 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Pabpc2Q62029 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pabpc2Q62029 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pabpc2Q62029 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Pabpc2Q62029 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Pabpc2Q62029 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pabpc2Q62029 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pabpc2Q62029 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Pabpc2Q62029 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pabpc2Q62029 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Pabpc2Q62029 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pabpc2Q62029 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pabpc2Q62029 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pabpc2Q62029 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pabpc2Q62029 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pabpc2Q62029 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pabpc2Q62029 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pabpc2Q62029 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pabpc2Q62029 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pabpc2Q62029 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pabpc2Q62029 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pabpc2Q62029 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pabpc2Q62029 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pabpc2Q62029 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pabpc2Q62029 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pabpc2Q62029 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pabpc2Q62029 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Pabpc2Q62029 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pabpc2Q62029 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Pabpc2Q62029 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pabpc2Q62029 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Pabpc2Q62029 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pabpc2Q62029 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pabpc2Q62029 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pabpc2Q62029 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pabpc2Q62029 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pabpc2Q62029 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pabpc2Q62029 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pabpc2Q62029 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pabpc2Q62029 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms