Protein–RNA interactions for Protein: Q61739

Itga6, Integrin alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga6Q61739 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Itga6Q61739 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Itga6Q61739 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Itga6Q61739 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Itga6Q61739 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Itga6Q61739 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Itga6Q61739 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Itga6Q61739 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Itga6Q61739 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Itga6Q61739 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Itga6Q61739 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Itga6Q61739 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Itga6Q61739 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Itga6Q61739 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Itga6Q61739 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Itga6Q61739 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Itga6Q61739 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Itga6Q61739 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Itga6Q61739 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Itga6Q61739 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Itga6Q61739 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Itga6Q61739 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Itga6Q61739 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Itga6Q61739 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Itga6Q61739 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Itga6Q61739 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Itga6Q61739 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Itga6Q61739 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Itga6Q61739 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Itga6Q61739 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Itga6Q61739 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Itga6Q61739 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Itga6Q61739 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Itga6Q61739 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Itga6Q61739 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Itga6Q61739 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Itga6Q61739 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Itga6Q61739 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Itga6Q61739 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Itga6Q61739 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Itga6Q61739 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Itga6Q61739 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Itga6Q61739 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Itga6Q61739 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Itga6Q61739 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Itga6Q61739 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Itga6Q61739 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Itga6Q61739 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Itga6Q61739 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Itga6Q61739 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Itga6Q61739 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Itga6Q61739 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Itga6Q61739 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Itga6Q61739 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Itga6Q61739 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Itga6Q61739 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Itga6Q61739 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Itga6Q61739 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Itga6Q61739 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Itga6Q61739 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Itga6Q61739 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Itga6Q61739 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Itga6Q61739 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Itga6Q61739 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Itga6Q61739 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Itga6Q61739 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Itga6Q61739 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Itga6Q61739 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Itga6Q61739 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Itga6Q61739 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Itga6Q61739 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Itga6Q61739 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Itga6Q61739 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Itga6Q61739 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Itga6Q61739 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Itga6Q61739 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Itga6Q61739 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Itga6Q61739 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Itga6Q61739 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Itga6Q61739 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Itga6Q61739 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Itga6Q61739 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Itga6Q61739 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Itga6Q61739 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Itga6Q61739 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Itga6Q61739 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Itga6Q61739 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Itga6Q61739 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Itga6Q61739 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Itga6Q61739 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Itga6Q61739 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Itga6Q61739 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Itga6Q61739 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Itga6Q61739 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Itga6Q61739 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Itga6Q61739 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Itga6Q61739 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Itga6Q61739 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Itga6Q61739 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Itga6Q61739 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms