Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PcolceQ61398 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PcolceQ61398 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PcolceQ61398 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
PcolceQ61398 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
PcolceQ61398 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
PcolceQ61398 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PcolceQ61398 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
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PcolceQ61398 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PcolceQ61398 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PcolceQ61398 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PcolceQ61398 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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PcolceQ61398 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PcolceQ61398 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PcolceQ61398 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
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PcolceQ61398 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PcolceQ61398 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PcolceQ61398 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PcolceQ61398 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
PcolceQ61398 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PcolceQ61398 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PcolceQ61398 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
PcolceQ61398 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
PcolceQ61398 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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PcolceQ61398 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PcolceQ61398 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PcolceQ61398 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PcolceQ61398 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PcolceQ61398 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PcolceQ61398 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PcolceQ61398 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PcolceQ61398 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
PcolceQ61398 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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PcolceQ61398 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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PcolceQ61398 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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PcolceQ61398 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PcolceQ61398 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
PcolceQ61398 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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PcolceQ61398 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PcolceQ61398 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PcolceQ61398 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PcolceQ61398 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PcolceQ61398 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PcolceQ61398 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
PcolceQ61398 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
PcolceQ61398 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PcolceQ61398 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PcolceQ61398 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PcolceQ61398 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PcolceQ61398 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PcolceQ61398 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PcolceQ61398 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PcolceQ61398 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PcolceQ61398 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PcolceQ61398 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PcolceQ61398 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PcolceQ61398 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
PcolceQ61398 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PcolceQ61398 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PcolceQ61398 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
PcolceQ61398 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PcolceQ61398 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PcolceQ61398 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
PcolceQ61398 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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