Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprnQ60673 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtprnQ60673 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtprnQ60673 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtprnQ60673 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtprnQ60673 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtprnQ60673 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PtprnQ60673 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PtprnQ60673 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PtprnQ60673 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PtprnQ60673 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtprnQ60673 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtprnQ60673 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtprnQ60673 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtprnQ60673 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtprnQ60673 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtprnQ60673 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtprnQ60673 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtprnQ60673 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtprnQ60673 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtprnQ60673 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtprnQ60673 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtprnQ60673 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtprnQ60673 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtprnQ60673 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtprnQ60673 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtprnQ60673 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtprnQ60673 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PtprnQ60673 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtprnQ60673 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtprnQ60673 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtprnQ60673 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtprnQ60673 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtprnQ60673 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtprnQ60673 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtprnQ60673 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PtprnQ60673 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtprnQ60673 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtprnQ60673 Gm6754-201ENSMUST00000117124 913 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PtprnQ60673 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtprnQ60673 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtprnQ60673 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtprnQ60673 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtprnQ60673 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtprnQ60673 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PtprnQ60673 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtprnQ60673 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtprnQ60673 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtprnQ60673 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtprnQ60673 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtprnQ60673 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtprnQ60673 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtprnQ60673 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtprnQ60673 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtprnQ60673 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtprnQ60673 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtprnQ60673 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtprnQ60673 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtprnQ60673 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtprnQ60673 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtprnQ60673 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtprnQ60673 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtprnQ60673 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtprnQ60673 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtprnQ60673 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtprnQ60673 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PtprnQ60673 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtprnQ60673 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtprnQ60673 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtprnQ60673 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtprnQ60673 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtprnQ60673 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtprnQ60673 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtprnQ60673 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtprnQ60673 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PtprnQ60673 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtprnQ60673 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtprnQ60673 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtprnQ60673 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtprnQ60673 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtprnQ60673 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PtprnQ60673 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtprnQ60673 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PtprnQ60673 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtprnQ60673 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtprnQ60673 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtprnQ60673 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtprnQ60673 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtprnQ60673 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtprnQ60673 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtprnQ60673 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtprnQ60673 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtprnQ60673 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtprnQ60673 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtprnQ60673 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PtprnQ60673 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtprnQ60673 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtprnQ60673 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtprnQ60673 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtprnQ60673 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PtprnQ60673 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.6 ms