Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXY1

Specc1, Cytospin-B, mousemouse

Predictions only

Length 1,067 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Specc1Q5SXY1 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Specc1Q5SXY1 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Specc1Q5SXY1 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Specc1Q5SXY1 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Specc1Q5SXY1 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Specc1Q5SXY1 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Specc1Q5SXY1 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Specc1Q5SXY1 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Specc1Q5SXY1 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Specc1Q5SXY1 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Specc1Q5SXY1 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Specc1Q5SXY1 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Specc1Q5SXY1 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Specc1Q5SXY1 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Specc1Q5SXY1 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Specc1Q5SXY1 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Specc1Q5SXY1 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Specc1Q5SXY1 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Specc1Q5SXY1 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Specc1Q5SXY1 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Specc1Q5SXY1 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Specc1Q5SXY1 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Specc1Q5SXY1 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Specc1Q5SXY1 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Specc1Q5SXY1 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Specc1Q5SXY1 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Specc1Q5SXY1 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Specc1Q5SXY1 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Specc1Q5SXY1 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Specc1Q5SXY1 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Specc1Q5SXY1 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Specc1Q5SXY1 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Specc1Q5SXY1 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Specc1Q5SXY1 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Specc1Q5SXY1 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Specc1Q5SXY1 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Specc1Q5SXY1 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Specc1Q5SXY1 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Specc1Q5SXY1 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Specc1Q5SXY1 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Specc1Q5SXY1 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Specc1Q5SXY1 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Specc1Q5SXY1 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Specc1Q5SXY1 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Specc1Q5SXY1 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Specc1Q5SXY1 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Specc1Q5SXY1 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Specc1Q5SXY1 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Specc1Q5SXY1 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Specc1Q5SXY1 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Specc1Q5SXY1 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Specc1Q5SXY1 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Specc1Q5SXY1 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Specc1Q5SXY1 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Specc1Q5SXY1 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Specc1Q5SXY1 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Specc1Q5SXY1 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Specc1Q5SXY1 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Specc1Q5SXY1 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Specc1Q5SXY1 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Specc1Q5SXY1 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Specc1Q5SXY1 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Specc1Q5SXY1 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Specc1Q5SXY1 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Specc1Q5SXY1 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Specc1Q5SXY1 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Specc1Q5SXY1 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Specc1Q5SXY1 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Specc1Q5SXY1 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Specc1Q5SXY1 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Specc1Q5SXY1 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Specc1Q5SXY1 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Specc1Q5SXY1 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Specc1Q5SXY1 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Specc1Q5SXY1 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Specc1Q5SXY1 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Specc1Q5SXY1 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Specc1Q5SXY1 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Specc1Q5SXY1 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Specc1Q5SXY1 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Specc1Q5SXY1 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Specc1Q5SXY1 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Specc1Q5SXY1 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Specc1Q5SXY1 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Specc1Q5SXY1 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Specc1Q5SXY1 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Specc1Q5SXY1 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Specc1Q5SXY1 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Specc1Q5SXY1 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Specc1Q5SXY1 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Specc1Q5SXY1 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Specc1Q5SXY1 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Specc1Q5SXY1 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Specc1Q5SXY1 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Specc1Q5SXY1 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Specc1Q5SXY1 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Specc1Q5SXY1 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Specc1Q5SXY1 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Specc1Q5SXY1 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Specc1Q5SXY1 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms