Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tsr1Q5SWD9 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tsr1Q5SWD9 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tsr1Q5SWD9 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tsr1Q5SWD9 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Tsr1Q5SWD9 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tsr1Q5SWD9 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tsr1Q5SWD9 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tsr1Q5SWD9 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tsr1Q5SWD9 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tsr1Q5SWD9 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tsr1Q5SWD9 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Tsr1Q5SWD9 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tsr1Q5SWD9 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tsr1Q5SWD9 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tsr1Q5SWD9 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tsr1Q5SWD9 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Tsr1Q5SWD9 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tsr1Q5SWD9 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Tsr1Q5SWD9 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tsr1Q5SWD9 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tsr1Q5SWD9 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tsr1Q5SWD9 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tsr1Q5SWD9 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tsr1Q5SWD9 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tsr1Q5SWD9 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tsr1Q5SWD9 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tsr1Q5SWD9 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Tsr1Q5SWD9 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tsr1Q5SWD9 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tsr1Q5SWD9 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tsr1Q5SWD9 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Tsr1Q5SWD9 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Tsr1Q5SWD9 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Tsr1Q5SWD9 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tsr1Q5SWD9 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tsr1Q5SWD9 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tsr1Q5SWD9 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tsr1Q5SWD9 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tsr1Q5SWD9 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tsr1Q5SWD9 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tsr1Q5SWD9 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tsr1Q5SWD9 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tsr1Q5SWD9 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tsr1Q5SWD9 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tsr1Q5SWD9 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tsr1Q5SWD9 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tsr1Q5SWD9 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tsr1Q5SWD9 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Tsr1Q5SWD9 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tsr1Q5SWD9 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tsr1Q5SWD9 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tsr1Q5SWD9 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tsr1Q5SWD9 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tsr1Q5SWD9 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Tsr1Q5SWD9 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tsr1Q5SWD9 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tsr1Q5SWD9 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tsr1Q5SWD9 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tsr1Q5SWD9 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tsr1Q5SWD9 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tsr1Q5SWD9 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tsr1Q5SWD9 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tsr1Q5SWD9 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tsr1Q5SWD9 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tsr1Q5SWD9 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tsr1Q5SWD9 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tsr1Q5SWD9 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tsr1Q5SWD9 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tsr1Q5SWD9 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tsr1Q5SWD9 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tsr1Q5SWD9 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tsr1Q5SWD9 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tsr1Q5SWD9 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tsr1Q5SWD9 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tsr1Q5SWD9 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tsr1Q5SWD9 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tsr1Q5SWD9 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tsr1Q5SWD9 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tsr1Q5SWD9 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tsr1Q5SWD9 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tsr1Q5SWD9 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tsr1Q5SWD9 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tsr1Q5SWD9 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tsr1Q5SWD9 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tsr1Q5SWD9 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tsr1Q5SWD9 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tsr1Q5SWD9 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tsr1Q5SWD9 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Tsr1Q5SWD9 Ccl25-201ENSMUST00000024004 1058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tsr1Q5SWD9 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tsr1Q5SWD9 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tsr1Q5SWD9 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tsr1Q5SWD9 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tsr1Q5SWD9 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tsr1Q5SWD9 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tsr1Q5SWD9 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tsr1Q5SWD9 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tsr1Q5SWD9 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tsr1Q5SWD9 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms