Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trappc1Q5NCF2 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trappc1Q5NCF2 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trappc1Q5NCF2 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trappc1Q5NCF2 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trappc1Q5NCF2 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trappc1Q5NCF2 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trappc1Q5NCF2 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trappc1Q5NCF2 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trappc1Q5NCF2 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trappc1Q5NCF2 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trappc1Q5NCF2 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trappc1Q5NCF2 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trappc1Q5NCF2 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trappc1Q5NCF2 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trappc1Q5NCF2 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trappc1Q5NCF2 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trappc1Q5NCF2 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trappc1Q5NCF2 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Trappc1Q5NCF2 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trappc1Q5NCF2 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trappc1Q5NCF2 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trappc1Q5NCF2 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trappc1Q5NCF2 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trappc1Q5NCF2 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trappc1Q5NCF2 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trappc1Q5NCF2 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trappc1Q5NCF2 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trappc1Q5NCF2 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trappc1Q5NCF2 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trappc1Q5NCF2 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trappc1Q5NCF2 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trappc1Q5NCF2 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trappc1Q5NCF2 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trappc1Q5NCF2 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trappc1Q5NCF2 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trappc1Q5NCF2 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trappc1Q5NCF2 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trappc1Q5NCF2 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trappc1Q5NCF2 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trappc1Q5NCF2 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trappc1Q5NCF2 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trappc1Q5NCF2 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trappc1Q5NCF2 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Trappc1Q5NCF2 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Trappc1Q5NCF2 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Trappc1Q5NCF2 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trappc1Q5NCF2 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trappc1Q5NCF2 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Trappc1Q5NCF2 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Trappc1Q5NCF2 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc1Q5NCF2 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc1Q5NCF2 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Trappc1Q5NCF2 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc1Q5NCF2 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc1Q5NCF2 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Trappc1Q5NCF2 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc1Q5NCF2 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Trappc1Q5NCF2 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc1Q5NCF2 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc1Q5NCF2 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc1Q5NCF2 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc1Q5NCF2 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc1Q5NCF2 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc1Q5NCF2 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc1Q5NCF2 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc1Q5NCF2 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc1Q5NCF2 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc1Q5NCF2 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Trappc1Q5NCF2 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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