Protein–RNA interactions for Protein: Q4TU90

Rhox3a, Reproductive homeobox 3A, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox3aQ4TU90 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rhox3aQ4TU90 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rhox3aQ4TU90 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rhox3aQ4TU90 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rhox3aQ4TU90 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rhox3aQ4TU90 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rhox3aQ4TU90 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rhox3aQ4TU90 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rhox3aQ4TU90 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rhox3aQ4TU90 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rhox3aQ4TU90 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rhox3aQ4TU90 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rhox3aQ4TU90 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rhox3aQ4TU90 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rhox3aQ4TU90 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rhox3aQ4TU90 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rhox3aQ4TU90 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rhox3aQ4TU90 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rhox3aQ4TU90 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rhox3aQ4TU90 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rhox3aQ4TU90 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rhox3aQ4TU90 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rhox3aQ4TU90 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rhox3aQ4TU90 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rhox3aQ4TU90 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rhox3aQ4TU90 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rhox3aQ4TU90 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rhox3aQ4TU90 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rhox3aQ4TU90 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rhox3aQ4TU90 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rhox3aQ4TU90 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rhox3aQ4TU90 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rhox3aQ4TU90 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rhox3aQ4TU90 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rhox3aQ4TU90 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rhox3aQ4TU90 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rhox3aQ4TU90 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rhox3aQ4TU90 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rhox3aQ4TU90 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rhox3aQ4TU90 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rhox3aQ4TU90 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rhox3aQ4TU90 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rhox3aQ4TU90 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rhox3aQ4TU90 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rhox3aQ4TU90 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rhox3aQ4TU90 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rhox3aQ4TU90 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rhox3aQ4TU90 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rhox3aQ4TU90 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rhox3aQ4TU90 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rhox3aQ4TU90 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rhox3aQ4TU90 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rhox3aQ4TU90 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rhox3aQ4TU90 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rhox3aQ4TU90 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rhox3aQ4TU90 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rhox3aQ4TU90 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rhox3aQ4TU90 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rhox3aQ4TU90 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rhox3aQ4TU90 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rhox3aQ4TU90 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rhox3aQ4TU90 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rhox3aQ4TU90 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rhox3aQ4TU90 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rhox3aQ4TU90 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rhox3aQ4TU90 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rhox3aQ4TU90 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rhox3aQ4TU90 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rhox3aQ4TU90 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rhox3aQ4TU90 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rhox3aQ4TU90 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rhox3aQ4TU90 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rhox3aQ4TU90 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rhox3aQ4TU90 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rhox3aQ4TU90 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Rhox3aQ4TU90 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rhox3aQ4TU90 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rhox3aQ4TU90 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rhox3aQ4TU90 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rhox3aQ4TU90 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rhox3aQ4TU90 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rhox3aQ4TU90 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rhox3aQ4TU90 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rhox3aQ4TU90 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rhox3aQ4TU90 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rhox3aQ4TU90 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rhox3aQ4TU90 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rhox3aQ4TU90 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rhox3aQ4TU90 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rhox3aQ4TU90 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rhox3aQ4TU90 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rhox3aQ4TU90 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rhox3aQ4TU90 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rhox3aQ4TU90 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rhox3aQ4TU90 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rhox3aQ4TU90 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rhox3aQ4TU90 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rhox3aQ4TU90 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rhox3aQ4TU90 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rhox3aQ4TU90 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.5 ms