Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0G7

Garnl3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Garnl3Q3V0G7 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Garnl3Q3V0G7 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Garnl3Q3V0G7 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Garnl3Q3V0G7 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Garnl3Q3V0G7 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Garnl3Q3V0G7 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Garnl3Q3V0G7 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Garnl3Q3V0G7 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Garnl3Q3V0G7 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Garnl3Q3V0G7 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Garnl3Q3V0G7 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Garnl3Q3V0G7 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Garnl3Q3V0G7 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Garnl3Q3V0G7 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Garnl3Q3V0G7 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Garnl3Q3V0G7 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Garnl3Q3V0G7 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Garnl3Q3V0G7 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Garnl3Q3V0G7 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Garnl3Q3V0G7 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Garnl3Q3V0G7 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Garnl3Q3V0G7 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Garnl3Q3V0G7 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Garnl3Q3V0G7 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Garnl3Q3V0G7 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Garnl3Q3V0G7 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Garnl3Q3V0G7 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Garnl3Q3V0G7 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Garnl3Q3V0G7 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Garnl3Q3V0G7 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Garnl3Q3V0G7 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Garnl3Q3V0G7 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Garnl3Q3V0G7 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Garnl3Q3V0G7 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Garnl3Q3V0G7 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Garnl3Q3V0G7 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Garnl3Q3V0G7 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Garnl3Q3V0G7 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Garnl3Q3V0G7 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Garnl3Q3V0G7 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Garnl3Q3V0G7 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Garnl3Q3V0G7 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Garnl3Q3V0G7 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Garnl3Q3V0G7 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Garnl3Q3V0G7 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Garnl3Q3V0G7 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Garnl3Q3V0G7 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Garnl3Q3V0G7 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Garnl3Q3V0G7 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Garnl3Q3V0G7 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Garnl3Q3V0G7 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Garnl3Q3V0G7 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Garnl3Q3V0G7 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Garnl3Q3V0G7 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Garnl3Q3V0G7 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Garnl3Q3V0G7 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Garnl3Q3V0G7 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Garnl3Q3V0G7 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Garnl3Q3V0G7 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Garnl3Q3V0G7 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Garnl3Q3V0G7 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Garnl3Q3V0G7 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Garnl3Q3V0G7 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Garnl3Q3V0G7 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Garnl3Q3V0G7 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Garnl3Q3V0G7 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Garnl3Q3V0G7 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Garnl3Q3V0G7 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Garnl3Q3V0G7 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Garnl3Q3V0G7 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Garnl3Q3V0G7 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Garnl3Q3V0G7 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Garnl3Q3V0G7 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Garnl3Q3V0G7 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Garnl3Q3V0G7 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Garnl3Q3V0G7 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Garnl3Q3V0G7 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Garnl3Q3V0G7 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Garnl3Q3V0G7 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Garnl3Q3V0G7 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Garnl3Q3V0G7 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Garnl3Q3V0G7 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Garnl3Q3V0G7 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Garnl3Q3V0G7 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Garnl3Q3V0G7 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Garnl3Q3V0G7 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Garnl3Q3V0G7 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Garnl3Q3V0G7 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Garnl3Q3V0G7 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Garnl3Q3V0G7 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Garnl3Q3V0G7 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Garnl3Q3V0G7 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Garnl3Q3V0G7 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Garnl3Q3V0G7 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Garnl3Q3V0G7 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Garnl3Q3V0G7 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Garnl3Q3V0G7 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Garnl3Q3V0G7 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Garnl3Q3V0G7 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Garnl3Q3V0G7 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms