Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
E130208F15RikQ3UPV3 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
E130208F15RikQ3UPV3 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms