Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW6

Ccdc33, Coiled-coil domain-containing protein 33, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc33Q3ULW6 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc33Q3ULW6 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc33Q3ULW6 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc33Q3ULW6 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc33Q3ULW6 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc33Q3ULW6 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc33Q3ULW6 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc33Q3ULW6 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc33Q3ULW6 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc33Q3ULW6 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc33Q3ULW6 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc33Q3ULW6 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc33Q3ULW6 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc33Q3ULW6 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc33Q3ULW6 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc33Q3ULW6 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc33Q3ULW6 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc33Q3ULW6 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc33Q3ULW6 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc33Q3ULW6 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc33Q3ULW6 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc33Q3ULW6 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc33Q3ULW6 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc33Q3ULW6 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc33Q3ULW6 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc33Q3ULW6 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc33Q3ULW6 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc33Q3ULW6 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc33Q3ULW6 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc33Q3ULW6 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc33Q3ULW6 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc33Q3ULW6 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc33Q3ULW6 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc33Q3ULW6 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc33Q3ULW6 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc33Q3ULW6 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc33Q3ULW6 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc33Q3ULW6 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc33Q3ULW6 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc33Q3ULW6 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc33Q3ULW6 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc33Q3ULW6 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc33Q3ULW6 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc33Q3ULW6 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc33Q3ULW6 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc33Q3ULW6 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc33Q3ULW6 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc33Q3ULW6 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc33Q3ULW6 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc33Q3ULW6 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc33Q3ULW6 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc33Q3ULW6 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc33Q3ULW6 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc33Q3ULW6 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc33Q3ULW6 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc33Q3ULW6 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc33Q3ULW6 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc33Q3ULW6 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc33Q3ULW6 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc33Q3ULW6 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc33Q3ULW6 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc33Q3ULW6 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc33Q3ULW6 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc33Q3ULW6 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc33Q3ULW6 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc33Q3ULW6 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc33Q3ULW6 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc33Q3ULW6 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc33Q3ULW6 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc33Q3ULW6 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc33Q3ULW6 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc33Q3ULW6 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc33Q3ULW6 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc33Q3ULW6 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc33Q3ULW6 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc33Q3ULW6 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc33Q3ULW6 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc33Q3ULW6 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc33Q3ULW6 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc33Q3ULW6 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc33Q3ULW6 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc33Q3ULW6 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc33Q3ULW6 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc33Q3ULW6 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc33Q3ULW6 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc33Q3ULW6 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc33Q3ULW6 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc33Q3ULW6 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc33Q3ULW6 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc33Q3ULW6 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc33Q3ULW6 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc33Q3ULW6 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc33Q3ULW6 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc33Q3ULW6 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc33Q3ULW6 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc33Q3ULW6 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc33Q3ULW6 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc33Q3ULW6 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc33Q3ULW6 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccdc33Q3ULW6 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms