Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKJ7

Smu1, WD40 repeat-containing protein SMU1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smu1Q3UKJ7 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smu1Q3UKJ7 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smu1Q3UKJ7 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smu1Q3UKJ7 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smu1Q3UKJ7 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smu1Q3UKJ7 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smu1Q3UKJ7 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smu1Q3UKJ7 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smu1Q3UKJ7 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smu1Q3UKJ7 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smu1Q3UKJ7 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smu1Q3UKJ7 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smu1Q3UKJ7 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Smu1Q3UKJ7 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smu1Q3UKJ7 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smu1Q3UKJ7 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smu1Q3UKJ7 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smu1Q3UKJ7 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smu1Q3UKJ7 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smu1Q3UKJ7 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Smu1Q3UKJ7 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smu1Q3UKJ7 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smu1Q3UKJ7 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Smu1Q3UKJ7 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smu1Q3UKJ7 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smu1Q3UKJ7 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smu1Q3UKJ7 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smu1Q3UKJ7 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smu1Q3UKJ7 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smu1Q3UKJ7 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smu1Q3UKJ7 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smu1Q3UKJ7 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smu1Q3UKJ7 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Smu1Q3UKJ7 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Smu1Q3UKJ7 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smu1Q3UKJ7 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smu1Q3UKJ7 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smu1Q3UKJ7 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smu1Q3UKJ7 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smu1Q3UKJ7 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smu1Q3UKJ7 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smu1Q3UKJ7 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smu1Q3UKJ7 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smu1Q3UKJ7 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smu1Q3UKJ7 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smu1Q3UKJ7 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smu1Q3UKJ7 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smu1Q3UKJ7 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smu1Q3UKJ7 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smu1Q3UKJ7 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smu1Q3UKJ7 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smu1Q3UKJ7 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Smu1Q3UKJ7 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smu1Q3UKJ7 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smu1Q3UKJ7 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smu1Q3UKJ7 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smu1Q3UKJ7 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smu1Q3UKJ7 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smu1Q3UKJ7 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smu1Q3UKJ7 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smu1Q3UKJ7 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smu1Q3UKJ7 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smu1Q3UKJ7 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smu1Q3UKJ7 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Smu1Q3UKJ7 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smu1Q3UKJ7 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smu1Q3UKJ7 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Smu1Q3UKJ7 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smu1Q3UKJ7 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smu1Q3UKJ7 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smu1Q3UKJ7 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smu1Q3UKJ7 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smu1Q3UKJ7 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smu1Q3UKJ7 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smu1Q3UKJ7 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smu1Q3UKJ7 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smu1Q3UKJ7 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smu1Q3UKJ7 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smu1Q3UKJ7 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smu1Q3UKJ7 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Smu1Q3UKJ7 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smu1Q3UKJ7 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smu1Q3UKJ7 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smu1Q3UKJ7 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smu1Q3UKJ7 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smu1Q3UKJ7 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smu1Q3UKJ7 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smu1Q3UKJ7 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Smu1Q3UKJ7 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smu1Q3UKJ7 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Smu1Q3UKJ7 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Smu1Q3UKJ7 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smu1Q3UKJ7 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smu1Q3UKJ7 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smu1Q3UKJ7 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smu1Q3UKJ7 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smu1Q3UKJ7 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smu1Q3UKJ7 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smu1Q3UKJ7 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Smu1Q3UKJ7 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms