Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHD6

Snx27, Sorting nexin-27, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx27Q3UHD6 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx27Q3UHD6 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx27Q3UHD6 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx27Q3UHD6 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx27Q3UHD6 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx27Q3UHD6 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx27Q3UHD6 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx27Q3UHD6 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx27Q3UHD6 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx27Q3UHD6 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx27Q3UHD6 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx27Q3UHD6 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx27Q3UHD6 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx27Q3UHD6 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx27Q3UHD6 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx27Q3UHD6 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx27Q3UHD6 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx27Q3UHD6 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx27Q3UHD6 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snx27Q3UHD6 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx27Q3UHD6 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx27Q3UHD6 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx27Q3UHD6 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx27Q3UHD6 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx27Q3UHD6 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx27Q3UHD6 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx27Q3UHD6 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx27Q3UHD6 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx27Q3UHD6 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx27Q3UHD6 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx27Q3UHD6 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx27Q3UHD6 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx27Q3UHD6 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx27Q3UHD6 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx27Q3UHD6 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx27Q3UHD6 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx27Q3UHD6 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx27Q3UHD6 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx27Q3UHD6 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx27Q3UHD6 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx27Q3UHD6 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snx27Q3UHD6 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx27Q3UHD6 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx27Q3UHD6 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx27Q3UHD6 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx27Q3UHD6 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx27Q3UHD6 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx27Q3UHD6 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx27Q3UHD6 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx27Q3UHD6 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx27Q3UHD6 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx27Q3UHD6 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx27Q3UHD6 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx27Q3UHD6 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx27Q3UHD6 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx27Q3UHD6 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx27Q3UHD6 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx27Q3UHD6 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx27Q3UHD6 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx27Q3UHD6 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snx27Q3UHD6 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx27Q3UHD6 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx27Q3UHD6 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx27Q3UHD6 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx27Q3UHD6 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx27Q3UHD6 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx27Q3UHD6 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx27Q3UHD6 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx27Q3UHD6 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx27Q3UHD6 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx27Q3UHD6 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx27Q3UHD6 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx27Q3UHD6 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx27Q3UHD6 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx27Q3UHD6 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx27Q3UHD6 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx27Q3UHD6 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx27Q3UHD6 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx27Q3UHD6 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx27Q3UHD6 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx27Q3UHD6 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx27Q3UHD6 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx27Q3UHD6 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx27Q3UHD6 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx27Q3UHD6 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx27Q3UHD6 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx27Q3UHD6 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx27Q3UHD6 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx27Q3UHD6 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx27Q3UHD6 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx27Q3UHD6 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Snx27Q3UHD6 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snx27Q3UHD6 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snx27Q3UHD6 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snx27Q3UHD6 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snx27Q3UHD6 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snx27Q3UHD6 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snx27Q3UHD6 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snx27Q3UHD6 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Snx27Q3UHD6 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms