Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2S8

Hvcn1, Voltage-gated hydrogen channel 1, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hvcn1Q3U2S8 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
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Hvcn1Q3U2S8 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hvcn1Q3U2S8 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Hvcn1Q3U2S8 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Hvcn1Q3U2S8 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Hvcn1Q3U2S8 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Hvcn1Q3U2S8 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Hvcn1Q3U2S8 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hvcn1Q3U2S8 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hvcn1Q3U2S8 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hvcn1Q3U2S8 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hvcn1Q3U2S8 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hvcn1Q3U2S8 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hvcn1Q3U2S8 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hvcn1Q3U2S8 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hvcn1Q3U2S8 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hvcn1Q3U2S8 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hvcn1Q3U2S8 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hvcn1Q3U2S8 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hvcn1Q3U2S8 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hvcn1Q3U2S8 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Hvcn1Q3U2S8 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hvcn1Q3U2S8 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hvcn1Q3U2S8 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hvcn1Q3U2S8 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hvcn1Q3U2S8 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Hvcn1Q3U2S8 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hvcn1Q3U2S8 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hvcn1Q3U2S8 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hvcn1Q3U2S8 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hvcn1Q3U2S8 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hvcn1Q3U2S8 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hvcn1Q3U2S8 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hvcn1Q3U2S8 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hvcn1Q3U2S8 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hvcn1Q3U2S8 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hvcn1Q3U2S8 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hvcn1Q3U2S8 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hvcn1Q3U2S8 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hvcn1Q3U2S8 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Hvcn1Q3U2S8 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hvcn1Q3U2S8 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hvcn1Q3U2S8 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hvcn1Q3U2S8 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
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Hvcn1Q3U2S8 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hvcn1Q3U2S8 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hvcn1Q3U2S8 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hvcn1Q3U2S8 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hvcn1Q3U2S8 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Hvcn1Q3U2S8 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hvcn1Q3U2S8 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hvcn1Q3U2S8 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hvcn1Q3U2S8 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hvcn1Q3U2S8 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hvcn1Q3U2S8 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hvcn1Q3U2S8 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hvcn1Q3U2S8 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hvcn1Q3U2S8 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Hvcn1Q3U2S8 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
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Hvcn1Q3U2S8 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hvcn1Q3U2S8 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hvcn1Q3U2S8 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hvcn1Q3U2S8 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hvcn1Q3U2S8 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
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Hvcn1Q3U2S8 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hvcn1Q3U2S8 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hvcn1Q3U2S8 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hvcn1Q3U2S8 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Hvcn1Q3U2S8 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hvcn1Q3U2S8 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hvcn1Q3U2S8 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hvcn1Q3U2S8 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hvcn1Q3U2S8 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hvcn1Q3U2S8 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hvcn1Q3U2S8 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Hvcn1Q3U2S8 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hvcn1Q3U2S8 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hvcn1Q3U2S8 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hvcn1Q3U2S8 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hvcn1Q3U2S8 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hvcn1Q3U2S8 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hvcn1Q3U2S8 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hvcn1Q3U2S8 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hvcn1Q3U2S8 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hvcn1Q3U2S8 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hvcn1Q3U2S8 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hvcn1Q3U2S8 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hvcn1Q3U2S8 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hvcn1Q3U2S8 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hvcn1Q3U2S8 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hvcn1Q3U2S8 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hvcn1Q3U2S8 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hvcn1Q3U2S8 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hvcn1Q3U2S8 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hvcn1Q3U2S8 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hvcn1Q3U2S8 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms