Protein–RNA interactions for Protein: Q3TAP4

Ap5b1, AP-5 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap5b1Q3TAP4 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ap5b1Q3TAP4 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ap5b1Q3TAP4 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ap5b1Q3TAP4 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ap5b1Q3TAP4 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ap5b1Q3TAP4 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ap5b1Q3TAP4 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ap5b1Q3TAP4 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ap5b1Q3TAP4 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ap5b1Q3TAP4 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ap5b1Q3TAP4 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ap5b1Q3TAP4 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ap5b1Q3TAP4 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ap5b1Q3TAP4 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ap5b1Q3TAP4 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ap5b1Q3TAP4 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ap5b1Q3TAP4 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ap5b1Q3TAP4 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ap5b1Q3TAP4 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ap5b1Q3TAP4 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ap5b1Q3TAP4 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ap5b1Q3TAP4 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ap5b1Q3TAP4 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ap5b1Q3TAP4 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ap5b1Q3TAP4 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ap5b1Q3TAP4 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ap5b1Q3TAP4 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ap5b1Q3TAP4 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ap5b1Q3TAP4 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ap5b1Q3TAP4 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ap5b1Q3TAP4 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ap5b1Q3TAP4 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ap5b1Q3TAP4 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ap5b1Q3TAP4 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ap5b1Q3TAP4 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ap5b1Q3TAP4 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ap5b1Q3TAP4 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ap5b1Q3TAP4 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ap5b1Q3TAP4 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ap5b1Q3TAP4 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ap5b1Q3TAP4 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ap5b1Q3TAP4 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ap5b1Q3TAP4 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ap5b1Q3TAP4 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ap5b1Q3TAP4 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ap5b1Q3TAP4 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ap5b1Q3TAP4 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ap5b1Q3TAP4 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ap5b1Q3TAP4 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ap5b1Q3TAP4 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ap5b1Q3TAP4 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ap5b1Q3TAP4 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ap5b1Q3TAP4 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ap5b1Q3TAP4 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ap5b1Q3TAP4 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ap5b1Q3TAP4 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ap5b1Q3TAP4 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ap5b1Q3TAP4 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ap5b1Q3TAP4 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ap5b1Q3TAP4 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ap5b1Q3TAP4 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ap5b1Q3TAP4 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ap5b1Q3TAP4 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ap5b1Q3TAP4 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ap5b1Q3TAP4 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ap5b1Q3TAP4 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ap5b1Q3TAP4 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ap5b1Q3TAP4 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ap5b1Q3TAP4 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ap5b1Q3TAP4 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ap5b1Q3TAP4 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ap5b1Q3TAP4 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ap5b1Q3TAP4 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ap5b1Q3TAP4 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ap5b1Q3TAP4 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ap5b1Q3TAP4 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ap5b1Q3TAP4 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ap5b1Q3TAP4 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ap5b1Q3TAP4 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ap5b1Q3TAP4 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ap5b1Q3TAP4 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ap5b1Q3TAP4 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ap5b1Q3TAP4 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ap5b1Q3TAP4 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ap5b1Q3TAP4 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ap5b1Q3TAP4 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ap5b1Q3TAP4 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ap5b1Q3TAP4 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ap5b1Q3TAP4 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ap5b1Q3TAP4 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ap5b1Q3TAP4 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ap5b1Q3TAP4 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ap5b1Q3TAP4 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ap5b1Q3TAP4 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ap5b1Q3TAP4 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ap5b1Q3TAP4 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ap5b1Q3TAP4 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ap5b1Q3TAP4 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Ap5b1Q3TAP4 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ap5b1Q3TAP4 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms