Protein–RNA interactions for Protein: Q31093

H2-M3, Histocompatibility 2, M region locus 3, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M3Q31093 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
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H2-M3Q31093 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
H2-M3Q31093 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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H2-M3Q31093 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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H2-M3Q31093 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2-M3Q31093 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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H2-M3Q31093 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2-M3Q31093 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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H2-M3Q31093 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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H2-M3Q31093 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2-M3Q31093 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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H2-M3Q31093 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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H2-M3Q31093 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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H2-M3Q31093 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms