Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Vps8Q0P5W1 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vps8Q0P5W1 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Vps8Q0P5W1 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vps8Q0P5W1 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vps8Q0P5W1 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vps8Q0P5W1 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vps8Q0P5W1 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vps8Q0P5W1 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vps8Q0P5W1 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vps8Q0P5W1 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vps8Q0P5W1 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vps8Q0P5W1 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vps8Q0P5W1 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vps8Q0P5W1 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Vps8Q0P5W1 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vps8Q0P5W1 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Vps8Q0P5W1 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vps8Q0P5W1 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vps8Q0P5W1 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vps8Q0P5W1 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vps8Q0P5W1 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vps8Q0P5W1 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vps8Q0P5W1 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Vps8Q0P5W1 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vps8Q0P5W1 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vps8Q0P5W1 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vps8Q0P5W1 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vps8Q0P5W1 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vps8Q0P5W1 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vps8Q0P5W1 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Vps8Q0P5W1 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vps8Q0P5W1 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vps8Q0P5W1 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vps8Q0P5W1 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vps8Q0P5W1 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vps8Q0P5W1 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Vps8Q0P5W1 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Vps8Q0P5W1 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vps8Q0P5W1 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vps8Q0P5W1 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vps8Q0P5W1 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vps8Q0P5W1 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vps8Q0P5W1 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vps8Q0P5W1 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vps8Q0P5W1 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vps8Q0P5W1 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vps8Q0P5W1 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vps8Q0P5W1 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vps8Q0P5W1 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vps8Q0P5W1 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vps8Q0P5W1 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vps8Q0P5W1 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vps8Q0P5W1 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vps8Q0P5W1 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vps8Q0P5W1 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vps8Q0P5W1 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vps8Q0P5W1 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vps8Q0P5W1 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Vps8Q0P5W1 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vps8Q0P5W1 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vps8Q0P5W1 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vps8Q0P5W1 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vps8Q0P5W1 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vps8Q0P5W1 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vps8Q0P5W1 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vps8Q0P5W1 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vps8Q0P5W1 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vps8Q0P5W1 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vps8Q0P5W1 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vps8Q0P5W1 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vps8Q0P5W1 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vps8Q0P5W1 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vps8Q0P5W1 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vps8Q0P5W1 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vps8Q0P5W1 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vps8Q0P5W1 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vps8Q0P5W1 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vps8Q0P5W1 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vps8Q0P5W1 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vps8Q0P5W1 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vps8Q0P5W1 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vps8Q0P5W1 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vps8Q0P5W1 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vps8Q0P5W1 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vps8Q0P5W1 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vps8Q0P5W1 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vps8Q0P5W1 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vps8Q0P5W1 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vps8Q0P5W1 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Vps8Q0P5W1 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vps8Q0P5W1 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vps8Q0P5W1 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vps8Q0P5W1 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Vps8Q0P5W1 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vps8Q0P5W1 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vps8Q0P5W1 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vps8Q0P5W1 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vps8Q0P5W1 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vps8Q0P5W1 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms