Protein–RNA interactions for Protein: Q08369

Gata4, Transcription factor GATA-4, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata4Q08369 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gata4Q08369 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gata4Q08369 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gata4Q08369 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Gata4Q08369 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gata4Q08369 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gata4Q08369 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gata4Q08369 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gata4Q08369 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gata4Q08369 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gata4Q08369 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gata4Q08369 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Gata4Q08369 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gata4Q08369 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gata4Q08369 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gata4Q08369 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gata4Q08369 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gata4Q08369 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gata4Q08369 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gata4Q08369 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gata4Q08369 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gata4Q08369 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gata4Q08369 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gata4Q08369 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gata4Q08369 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gata4Q08369 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Gata4Q08369 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gata4Q08369 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gata4Q08369 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gata4Q08369 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gata4Q08369 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gata4Q08369 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gata4Q08369 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gata4Q08369 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gata4Q08369 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gata4Q08369 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gata4Q08369 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gata4Q08369 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gata4Q08369 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gata4Q08369 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gata4Q08369 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gata4Q08369 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Gata4Q08369 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gata4Q08369 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gata4Q08369 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gata4Q08369 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gata4Q08369 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gata4Q08369 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Gata4Q08369 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gata4Q08369 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gata4Q08369 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gata4Q08369 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gata4Q08369 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gata4Q08369 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gata4Q08369 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gata4Q08369 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gata4Q08369 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gata4Q08369 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gata4Q08369 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gata4Q08369 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gata4Q08369 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gata4Q08369 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Gata4Q08369 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Gata4Q08369 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Gata4Q08369 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gata4Q08369 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gata4Q08369 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gata4Q08369 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gata4Q08369 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Gata4Q08369 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gata4Q08369 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gata4Q08369 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gata4Q08369 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gata4Q08369 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gata4Q08369 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Gata4Q08369 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gata4Q08369 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Gata4Q08369 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Gata4Q08369 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gata4Q08369 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gata4Q08369 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gata4Q08369 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gata4Q08369 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gata4Q08369 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gata4Q08369 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gata4Q08369 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Gata4Q08369 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Gata4Q08369 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Gata4Q08369 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gata4Q08369 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gata4Q08369 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gata4Q08369 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gata4Q08369 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gata4Q08369 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gata4Q08369 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gata4Q08369 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gata4Q08369 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gata4Q08369 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gata4Q08369 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gata4Q08369 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms