Protein–RNA interactions for Protein: Q07916

Pou6f1, POU domain, class 6, transcription factor 1, mousemouse

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Length 301 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou6f1Q07916 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Pou6f1Q07916 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pou6f1Q07916 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pou6f1Q07916 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pou6f1Q07916 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pou6f1Q07916 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pou6f1Q07916 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
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Pou6f1Q07916 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pou6f1Q07916 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pou6f1Q07916 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pou6f1Q07916 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pou6f1Q07916 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pou6f1Q07916 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pou6f1Q07916 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pou6f1Q07916 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pou6f1Q07916 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pou6f1Q07916 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pou6f1Q07916 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pou6f1Q07916 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pou6f1Q07916 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pou6f1Q07916 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Pou6f1Q07916 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pou6f1Q07916 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pou6f1Q07916 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pou6f1Q07916 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Pou6f1Q07916 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Pou6f1Q07916 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Pou6f1Q07916 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Pou6f1Q07916 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pou6f1Q07916 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pou6f1Q07916 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pou6f1Q07916 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Pou6f1Q07916 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pou6f1Q07916 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pou6f1Q07916 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pou6f1Q07916 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pou6f1Q07916 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pou6f1Q07916 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pou6f1Q07916 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Pou6f1Q07916 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pou6f1Q07916 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pou6f1Q07916 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Pou6f1Q07916 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Pou6f1Q07916 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pou6f1Q07916 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pou6f1Q07916 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Pou6f1Q07916 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pou6f1Q07916 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pou6f1Q07916 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Pou6f1Q07916 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pou6f1Q07916 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pou6f1Q07916 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pou6f1Q07916 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pou6f1Q07916 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pou6f1Q07916 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pou6f1Q07916 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Pou6f1Q07916 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pou6f1Q07916 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pou6f1Q07916 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pou6f1Q07916 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pou6f1Q07916 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pou6f1Q07916 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pou6f1Q07916 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pou6f1Q07916 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pou6f1Q07916 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pou6f1Q07916 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pou6f1Q07916 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pou6f1Q07916 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms