Protein–RNA interactions for Protein: Q07475

Nrep, Neuronal regeneration-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrepQ07475 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
NrepQ07475 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
NrepQ07475 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
NrepQ07475 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
NrepQ07475 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
NrepQ07475 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
NrepQ07475 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
NrepQ07475 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
NrepQ07475 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
NrepQ07475 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
NrepQ07475 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
NrepQ07475 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
NrepQ07475 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
NrepQ07475 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
NrepQ07475 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
NrepQ07475 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
NrepQ07475 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
NrepQ07475 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
NrepQ07475 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
NrepQ07475 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
NrepQ07475 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
NrepQ07475 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
NrepQ07475 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
NrepQ07475 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
NrepQ07475 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
NrepQ07475 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
NrepQ07475 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
NrepQ07475 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
NrepQ07475 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
NrepQ07475 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
NrepQ07475 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
NrepQ07475 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
NrepQ07475 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
NrepQ07475 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NrepQ07475 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NrepQ07475 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NrepQ07475 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NrepQ07475 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NrepQ07475 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NrepQ07475 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NrepQ07475 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NrepQ07475 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NrepQ07475 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NrepQ07475 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NrepQ07475 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NrepQ07475 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NrepQ07475 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NrepQ07475 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NrepQ07475 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NrepQ07475 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NrepQ07475 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
NrepQ07475 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NrepQ07475 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NrepQ07475 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NrepQ07475 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NrepQ07475 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NrepQ07475 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NrepQ07475 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NrepQ07475 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
NrepQ07475 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
NrepQ07475 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NrepQ07475 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NrepQ07475 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NrepQ07475 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NrepQ07475 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
NrepQ07475 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
NrepQ07475 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
NrepQ07475 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NrepQ07475 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NrepQ07475 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NrepQ07475 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NrepQ07475 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NrepQ07475 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NrepQ07475 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
NrepQ07475 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NrepQ07475 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NrepQ07475 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
NrepQ07475 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms