Protein–RNA interactions for Protein: Q02085

Snai1, Zinc finger protein SNAI1, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai1Q02085 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Snai1Q02085 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Snai1Q02085 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Snai1Q02085 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Snai1Q02085 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Snai1Q02085 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Snai1Q02085 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Snai1Q02085 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Snai1Q02085 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Snai1Q02085 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Snai1Q02085 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Snai1Q02085 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Snai1Q02085 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Snai1Q02085 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Snai1Q02085 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Snai1Q02085 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Snai1Q02085 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Snai1Q02085 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Snai1Q02085 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Snai1Q02085 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Snai1Q02085 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Snai1Q02085 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Snai1Q02085 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Snai1Q02085 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Snai1Q02085 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Snai1Q02085 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Snai1Q02085 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Snai1Q02085 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Snai1Q02085 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Snai1Q02085 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Snai1Q02085 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Snai1Q02085 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Snai1Q02085 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Snai1Q02085 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Snai1Q02085 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Snai1Q02085 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Snai1Q02085 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Snai1Q02085 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Snai1Q02085 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Snai1Q02085 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Snai1Q02085 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Snai1Q02085 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Snai1Q02085 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Snai1Q02085 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Snai1Q02085 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Snai1Q02085 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Snai1Q02085 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Snai1Q02085 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Snai1Q02085 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Snai1Q02085 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Snai1Q02085 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Snai1Q02085 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Snai1Q02085 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Snai1Q02085 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Snai1Q02085 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Snai1Q02085 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Snai1Q02085 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Snai1Q02085 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Snai1Q02085 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Snai1Q02085 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Snai1Q02085 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Snai1Q02085 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Snai1Q02085 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Snai1Q02085 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Snai1Q02085 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Snai1Q02085 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Snai1Q02085 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Snai1Q02085 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Snai1Q02085 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Snai1Q02085 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Snai1Q02085 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Snai1Q02085 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Snai1Q02085 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Snai1Q02085 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Snai1Q02085 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Snai1Q02085 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Snai1Q02085 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Snai1Q02085 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Snai1Q02085 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Snai1Q02085 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Snai1Q02085 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Snai1Q02085 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Snai1Q02085 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Snai1Q02085 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Snai1Q02085 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Snai1Q02085 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Snai1Q02085 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Snai1Q02085 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Snai1Q02085 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Snai1Q02085 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Snai1Q02085 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Snai1Q02085 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Snai1Q02085 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Snai1Q02085 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Snai1Q02085 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Snai1Q02085 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Snai1Q02085 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Snai1Q02085 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Snai1Q02085 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Snai1Q02085 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.8 ms