Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Irx1P81068 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Irx1P81068 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Irx1P81068 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Irx1P81068 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Irx1P81068 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Irx1P81068 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Irx1P81068 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Irx1P81068 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Irx1P81068 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Irx1P81068 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Irx1P81068 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Irx1P81068 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Irx1P81068 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Irx1P81068 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Irx1P81068 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Irx1P81068 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Irx1P81068 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Irx1P81068 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Irx1P81068 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Irx1P81068 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Irx1P81068 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Irx1P81068 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Irx1P81068 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Irx1P81068 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Irx1P81068 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Irx1P81068 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Irx1P81068 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Irx1P81068 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Irx1P81068 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Irx1P81068 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Irx1P81068 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Irx1P81068 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Irx1P81068 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Irx1P81068 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Irx1P81068 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Irx1P81068 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Irx1P81068 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Irx1P81068 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Irx1P81068 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Irx1P81068 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Irx1P81068 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Irx1P81068 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Irx1P81068 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Irx1P81068 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Irx1P81068 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Irx1P81068 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Irx1P81068 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Irx1P81068 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Irx1P81068 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Irx1P81068 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Irx1P81068 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Irx1P81068 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Irx1P81068 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Irx1P81068 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Irx1P81068 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Irx1P81068 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Irx1P81068 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Irx1P81068 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Irx1P81068 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Irx1P81068 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Irx1P81068 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Irx1P81068 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Irx1P81068 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Irx1P81068 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Irx1P81068 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
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Irx1P81068 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Irx1P81068 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Irx1P81068 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Irx1P81068 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Irx1P81068 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Irx1P81068 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Irx1P81068 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Irx1P81068 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Irx1P81068 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Irx1P81068 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Irx1P81068 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Irx1P81068 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Irx1P81068 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Irx1P81068 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Irx1P81068 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Irx1P81068 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Irx1P81068 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Irx1P81068 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Irx1P81068 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Irx1P81068 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Irx1P81068 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Irx1P81068 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Irx1P81068 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Irx1P81068 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Irx1P81068 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Irx1P81068 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Irx1P81068 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Irx1P81068 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Irx1P81068 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Irx1P81068 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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